More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7203 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 581 aa  1186    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  42.48 
 
 		 606 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  39.01 
 
 		 600 aa  398  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  43.49 
 
 		 619 aa  393  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  40.07 
 
 		 606 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  35.52 
 
 		 592 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  34.02 
 
 		 618 aa  258  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  32.25 
 
 		 635 aa  257  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  33.11 
 
 		 592 aa  247  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  31.66 
 
 		 604 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 		 549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 		 549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 		 549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 548 aa  211  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 548 aa  209  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  29.83 
 
 		 555 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  28.99 
 
 		 557 aa  203  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  30.22 
 
 		 611 aa  196  9e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.59 
 
 		 586 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  26.95 
 
 		 597 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 		 581 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 541 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.3 
 
 		 567 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  26.6 
 
 		 585 aa  124  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 555 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 555 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  24.96 
 
 		 554 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.7 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 576 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 567 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 		 565 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  22.54 
 
 		 566 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 563 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  24.9 
 
 		 591 aa  107  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 550 aa  107  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  22.72 
 
 		 570 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 580 aa  102  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 558 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  23.2 
 
 		 567 aa  97.1  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 639 aa  94.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 617 aa  94  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 575 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.06 
 
 		 579 aa  90.1  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 575 aa  89.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  27.38 
 
 		 575 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  27.09 
 
 		 575 aa  87  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.8 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  23.2 
 
 		 532 aa  85.1  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0986  extracellular solute-binding protein family 5  35.47 
 
 		 683 aa  85.5  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.732347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  21.43 
 
 		 568 aa  83.6  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  25.62 
 
 		 575 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.62 
 
 		 575 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  25.66 
 
 		 575 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.62 
 
 		 575 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.34 
 
 		 555 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.07 
 
 		 559 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.94 
 
 		 511 aa  77.4  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 567 aa  77  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 595 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  22.63 
 
 		 551 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 535 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 569 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 551 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  22.53 
 
 		 566 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  22.55 
 
 		 614 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1226  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 536 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  23.22 
 
 		 603 aa  70.5  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.29 
 
 		 567 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1835  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 501 aa  69.3  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  21.8 
 
 		 556 aa  69.3  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 610 aa  68.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  23.51 
 
 		 587 aa  67.4  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0197  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 605 aa  67.4  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  21.47 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4022  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 536 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00714098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  25.7 
 
 		 510 aa  67  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 498 aa  66.6  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 525 aa  66.6  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.78 
 
 		 511 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  21.57 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  21.74 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  23.63 
 
 		 592 aa  65.1  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1411  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  22.84 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.23 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  22.43 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  22.03 
 
 		 590 aa  63.9  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  20.2 
 
 		 604 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>