More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3612 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  265  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  73.33 
 
 		 146 aa  200  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  71.85 
 
 		 136 aa  197  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  68.89 
 
 		 135 aa  187  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  65.19 
 
 		 135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 135 aa  176  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  64.44 
 
 		 135 aa  167  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  62.96 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  62.96 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  62.96 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  62.22 
 
 		 135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  46.32 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  45.59 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  44.12 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  38.64 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  40.46 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  38.81 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  38.85 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  30.88 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  30.88 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  30.15 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  35.77 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  35.77 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  30.88 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  34.06 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  30.15 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  30.88 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  30.88 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  39.45 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  39.45 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  40.37 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  38.97 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  44.76 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  29.93 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  31.85 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  31.85 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  41.77 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  33.83 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  37.8 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>