272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1376 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  72.64 
 
 		 871 aa  1261    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  73.62 
 
 		 875 aa  1265    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  80.6 
 
 		 881 aa  1377    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  62.56 
 
 		 856 aa  1052    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  100 
 
 		 867 aa  1763    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  65.29 
 
 		 899 aa  1105    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  47.23 
 
 		 820 aa  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  63.48 
 
 		 859 aa  1085    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  49.87 
 
 		 792 aa  707    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  67.75 
 
 		 860 aa  1129    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  48.64 
 
 		 811 aa  703    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  70.09 
 
 		 857 aa  1218    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  63.74 
 
 		 863 aa  1072    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  48.53 
 
 		 826 aa  670    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  66.24 
 
 		 884 aa  1102    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  67.94 
 
 		 836 aa  1151    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  65.12 
 
 		 842 aa  1115    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  66.2 
 
 		 852 aa  1149    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  67.41 
 
 		 841 aa  1134    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  63.48 
 
 		 859 aa  1085    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  63.93 
 
 		 859 aa  1066    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  48.58 
 
 		 800 aa  732    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  66.18 
 
 		 838 aa  1053    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  66.82 
 
 		 872 aa  1155    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  63.48 
 
 		 859 aa  1085    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  49.74 
 
 		 779 aa  679    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  75.39 
 
 		 859 aa  1290    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  63.24 
 
 		 859 aa  1053    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  70.07 
 
 		 944 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  42.26 
 
 		 841 aa  580  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  46.51 
 
 		 757 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  66.26 
 
 		 416 aa  530  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  66.06 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  47.83 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  48.18 
 
 		 392 aa  362  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  51.93 
 
 		 418 aa  353  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  50.13 
 
 		 435 aa  351  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  50 
 
 		 380 aa  343  8e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  49.57 
 
 		 386 aa  334  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  44.35 
 
 		 419 aa  320  1e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  49.39 
 
 		 376 aa  317  8e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  41.48 
 
 		 362 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  44.55 
 
 		 359 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  44.24 
 
 		 359 aa  308  3e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  45.15 
 
 		 370 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  42.55 
 
 		 359 aa  300  5e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  44.94 
 
 		 453 aa  298  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  43.98 
 
 		 358 aa  296  8e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  38.82 
 
 		 390 aa  292  2e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  41.53 
 
 		 352 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  43.48 
 
 		 352 aa  290  8e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  43.17 
 
 		 352 aa  286  9e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  46.48 
 
 		 356 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.73 
 
 		 565 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  44.34 
 
 		 384 aa  284  6.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  41.28 
 
 		 380 aa  282  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  47.32 
 
 		 419 aa  281  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  44.24 
 
 		 329 aa  280  7e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  46.41 
 
 		 331 aa  278  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  43.02 
 
 		 381 aa  278  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  40.87 
 
 		 367 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  41.93 
 
 		 351 aa  275  3e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  40.06 
 
 		 358 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3326  FO synthase  40.21 
 
 		 372 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.9768  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.69 
 
 		 382 aa  271  5e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  39.31 
 
 		 376 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  43.73 
 
 		 365 aa  269  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  38.84 
 
 		 384 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  38.84 
 
 		 384 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  41.39 
 
 		 391 aa  264  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  40.96 
 
 		 358 aa  264  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  41.39 
 
 		 325 aa  262  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  41.88 
 
 		 362 aa  262  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  41.25 
 
 		 366 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  44.01 
 
 		 327 aa  260  8e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  42.3 
 
 		 321 aa  259  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.52 
 
 		 737 aa  256  9e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.23 
 
 		 737 aa  256  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  41.02 
 
 		 358 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.64 
 
 		 741 aa  255  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  38.74 
 
 		 356 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  40.72 
 
 		 398 aa  254  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 362 aa  247  6.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  42.39 
 
 		 386 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  40 
 
 		 330 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  43.95 
 
 		 387 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  40.65 
 
 		 326 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  36.54 
 
 		 364 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  41.06 
 
 		 389 aa  234  5e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  36.54 
 
 		 362 aa  233  9e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  42.25 
 
 		 368 aa  231  4e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  42.81 
 
 		 393 aa  231  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  34.23 
 
 		 360 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  37.15 
 
 		 361 aa  226  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  35.92 
 
 		 367 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  34.65 
 
 		 361 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  37.57 
 
 		 360 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  38.6 
 
 		 355 aa  221  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  36.54 
 
 		 360 aa  221  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  41.72 
 
 		 372 aa  219  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>