More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0407 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0407  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 383 aa  768    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  62.9 
 
 		 605 aa  481  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  62.47 
 
 		 679 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  62.63 
 
 		 676 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  63 
 
 		 644 aa  477  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2353  transcription termination factor Rho  62.53 
 
 		 711 aa  474  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000144518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  63.81 
 
 		 704 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2620  transcription termination factor Rho  62.53 
 
 		 729 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0321  transcription termination factor Rho  60.32 
 
 		 662 aa  463  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1255  transcription termination factor Rho  62.23 
 
 		 696 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.864478  normal  0.0460813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09900  transcription termination factor Rho  59.84 
 
 		 751 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1058  transcription termination factor Rho  60.95 
 
 		 658 aa  458  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08060  transcription termination factor Rho  60.1 
 
 		 712 aa  455  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4150  transcription termination factor Rho  61.66 
 
 		 747 aa  454  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18390  transcription termination factor Rho  58.02 
 
 		 721 aa  456  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.945824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  59.38 
 
 		 674 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4746  transcription termination factor Rho  59.37 
 
 		 393 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1202  transcription termination factor Rho  60.48 
 
 		 668 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.246855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19310  transcription termination factor Rho  58.57 
 
 		 713 aa  448  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650817  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1284  transcription termination factor Rho  58.78 
 
 		 645 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.287408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1008  transcription termination factor Rho  60.42 
 
 		 670 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3722  transcription termination factor Rho  60.86 
 
 		 698 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.672937  normal  0.45086 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1787  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 680 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.810933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11324  transcription termination factor Rho  57.98 
 
 		 602 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1200  transcription termination factor Rho  58.15 
 
 		 689 aa  439  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  59.36 
 
 		 709 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3879  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 663 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  59.46 
 
 		 656 aa  435  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3893  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 663 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29930  transcription termination factor Rho  58.24 
 
 		 613 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.660333 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3967  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 663 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.625424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2098  transcription termination factor Rho  59.09 
 
 		 717 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0421474  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1747  transcription termination factor Rho  59.52 
 
 		 578 aa  432  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.179757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1301  transcription termination factor Rho  55.76 
 
 		 597 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1904  transcription termination factor Rho  56.57 
 
 		 662 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 684 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  56.2 
 
 		 691 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2560  transcription termination factor Rho  57.03 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.910753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1233  transcription termination factor Rho  53.08 
 
 		 653 aa  415  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  57.75 
 
 		 675 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  57.75 
 
 		 688 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  56.55 
 
 		 685 aa  403  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  55.49 
 
 		 642 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  54.14 
 
 		 420 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  54.77 
 
 		 546 aa  395  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  56.74 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09300  transcription termination factor Rho  54.77 
 
 		 638 aa  394  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.270012 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1811  transcription termination factor Rho  53.89 
 
 		 594 aa  393  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.186015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  52.41 
 
 		 498 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  55.9 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  55.74 
 
 		 416 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  52.19 
 
 		 419 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  52.19 
 
 		 419 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  52.19 
 
 		 419 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  52.19 
 
 		 419 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  50.95 
 
 		 419 aa  381  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  52.47 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  52.35 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  52.19 
 
 		 419 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  52.19 
 
 		 419 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  55.71 
 
 		 457 aa  381  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  50.82 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1990  transcription termination factor Rho  51.9 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  52.47 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3081  transcription termination factor Rho  53.35 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  51.74 
 
 		 418 aa  378  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1356  transcription termination factor Rho  54.62 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00013646  hitchhiker  0.000000585861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  51.51 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2293  transcription termination factor Rho  51.9 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.182483  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  52.89 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  52.47 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0778  transcription termination factor Rho  53.72 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  51.91 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  51.64 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  51.37 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  51.37 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  50.53 
 
 		 421 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  52.35 
 
 		 415 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  50.27 
 
 		 421 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  52.08 
 
 		 653 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  50.27 
 
 		 421 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0584  transcription termination factor Rho  51.37 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.290432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2310  transcription termination factor Rho  51.63 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  normal  0.229849 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4662  transcription termination factor Rho  49.05 
 
 		 604 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47410  transcription termination factor Rho  52.73 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  50.82 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  52.08 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  50.27 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  51.64 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  50.8 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  51.23 
 
 		 420 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  50.8 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2055  transcription termination factor Rho  51.23 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.224008  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0405  transcription termination factor Rho  50.95 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2375  transcription termination factor Rho  51.25 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  51.37 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  50.68 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  50.68 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  50 
 
 		 421 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  50.53 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>