196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0275 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 231 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  45.08 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  45.49 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  39.02 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  40.66 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  36.52 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  40.25 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  40.1 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 		 262 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  35.08 
 
 		 267 aa  102  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  37.21 
 
 		 267 aa  98.6  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4920  ABC-2 type transporter  42.71 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 247 aa  85.5  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 		 360 aa  82  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 413 aa  75.9  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.96 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  31.89 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.52 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  27.55 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  26.92 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  26.8 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.62 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 379 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  31.46 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 		 375 aa  55.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.2 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 378 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.18 
 
 		 377 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 377 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  30.77 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  31.74 
 
 		 391 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 378 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  31.18 
 
 		 377 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  31.18 
 
 		 377 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  31.18 
 
 		 377 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  31.18 
 
 		 377 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  31.18 
 
 		 377 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 377 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  31.18 
 
 		 377 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  31.18 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  31.18 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  31.18 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  31.18 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  31.18 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 304 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 384 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 388 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 391 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  26.02 
 
 		 382 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 		 391 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 384 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  29.41 
 
 		 380 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 384 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  28.57 
 
 		 382 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 		 391 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.58 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 356 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0382  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 365 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 		 376 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 		 376 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 336 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.98 
 
 		 378 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.6 
 
 		 285 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  24.04 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 371 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  27.39 
 
 		 385 aa  48.9  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>