122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4069 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  795    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  32.68 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  32.68 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  26.7 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  29.19 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.8 
 
 		 407 aa  99.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  27.71 
 
 		 756 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  26.05 
 
 		 402 aa  96.3  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.66 
 
 		 410 aa  93.6  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  27.85 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  29.33 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  28.76 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  24.5 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  28.28 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  26.21 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  30.26 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  25.41 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.59 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.47 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.88 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  27.53 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  24.2 
 
 		 914 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  24.2 
 
 		 900 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  24.2 
 
 		 900 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  25.81 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  23.9 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  26.91 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  25.44 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.64 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.68 
 
 		 723 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  24.42 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  24.75 
 
 		 891 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  24.89 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  27.98 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  26.1 
 
 		 924 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  24.31 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.15 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  24.33 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  23.74 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25.93 
 
 		 926 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  23.44 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  25.32 
 
 		 1033 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  27.16 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.58 
 
 		 904 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  25.58 
 
 		 904 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.37 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  25.74 
 
 		 912 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.53 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  22.65 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  25.93 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  25.62 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  26.1 
 
 		 894 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  25.93 
 
 		 896 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  24.2 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  25 
 
 		 428 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.16 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  30 
 
 		 440 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  22.91 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.88 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  25.29 
 
 		 414 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.13 
 
 		 726 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  24.1 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  21.68 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  23.21 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  23.84 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  25.7 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  23.33 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  23.33 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  20.18 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  25.59 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  24.9 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  24.9 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  38.03 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  27.08 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  23.21 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.88 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  23.73 
 
 		 575 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  20.33 
 
 		 436 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  22.76 
 
 		 414 aa  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  22.12 
 
 		 408 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  20.7 
 
 		 541 aa  49.7  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  23.93 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  24.42 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  21.34 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.01 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0732  hypothetical protein  26.27 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0029  protein of unknown function DUF201  25.97 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  31.51 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  22.59 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  25.49 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  27.1 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  25.09 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  24.21 
 
 		 449 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  23.94 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0021  hypothetical protein  22.73 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  23.12 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  23.38 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  26.9 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  18.66 
 
 		 373 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25 
 
 		 322 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>