More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6277 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 218 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  59.52 
 
 		 212 aa  248  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  47.41 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  36.1 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  36.79 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  36.67 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  54.13 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  48.54 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  41.54 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  35.44 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  43.43 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  42.7 
 
 		 134 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  39.56 
 
 		 140 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 152 aa  72  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 110 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 		 107 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 110 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 132 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  48.35 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6743  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  39.56 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  47.25 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  34.07 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  47.25 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  44.79 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  44.79 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  44.79 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  44.79 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 148 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 156 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  47.25 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 124 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 113 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  37 
 
 		 110 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  33.66 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  44.79 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6037  HxlR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.929576  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  34.21 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  43 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  28.37 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  37.89 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  32.46 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  42 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  37.14 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  42.27 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>