62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4276 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  524  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  36.88 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  27.4 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  29.08 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  28.68 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  29.68 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  27.3 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  30.66 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  26.6 
 
 		 280 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  28.17 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  30.74 
 
 		 223 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  30.3 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  32.08 
 
 		 298 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  32.05 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  31.17 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  33.97 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  25.7 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  27.37 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  27.32 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  24.81 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  31.28 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  27.96 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  32.78 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  29.05 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  24.65 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  31.03 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  27.43 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  30.04 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  28.64 
 
 		 358 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  24.12 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  31.21 
 
 		 318 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  24.4 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  26.34 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2431  hypothetical protein  30.48 
 
 		 600 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.482444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  34.81 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  24.86 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  32.6 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  30.57 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  36.08 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  35.14 
 
 		 284 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  28.11 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  27.01 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  28.97 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  28.31 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  26.34 
 
 		 417 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  22.58 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  24.88 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  30 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  24.88 
 
 		 347 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  25.94 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  23.97 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  26.18 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  27.46 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  24.84 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  24.77 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  30.06 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  28.19 
 
 		 318 aa  42.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  25 
 
 		 350 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>