157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2737 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  55.98 
 
 
732 aa  765    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  100 
 
 
708 aa  1440    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  44.09 
 
 
852 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  42.54 
 
 
721 aa  548  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  44.46 
 
 
717 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  40.17 
 
 
718 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  41.06 
 
 
738 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  34.29 
 
 
783 aa  422  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  34.29 
 
 
783 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  34.29 
 
 
783 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  34.29 
 
 
783 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  34.29 
 
 
783 aa  422  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  34.29 
 
 
783 aa  422  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  34.29 
 
 
783 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  34.29 
 
 
783 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  34.59 
 
 
790 aa  416  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  32.07 
 
 
896 aa  281  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  32.28 
 
 
896 aa  226  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  30.08 
 
 
581 aa  158  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  28.62 
 
 
543 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  27.74 
 
 
444 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  27.96 
 
 
478 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  28.53 
 
 
745 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  26 
 
 
452 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  26.92 
 
 
445 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  27.45 
 
 
441 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  26.38 
 
 
575 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  27.46 
 
 
450 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  27.57 
 
 
446 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  27.57 
 
 
446 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  27.48 
 
 
456 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  26.7 
 
 
432 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  23.1 
 
 
433 aa  99.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  25.62 
 
 
423 aa  97.1  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  26.12 
 
 
459 aa  96.3  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  26.87 
 
 
446 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  26.4 
 
 
446 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  24.61 
 
 
566 aa  95.1  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  26.39 
 
 
422 aa  94  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  26.22 
 
 
452 aa  90.1  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  24.27 
 
 
431 aa  87  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  28.22 
 
 
476 aa  87  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  23.79 
 
 
419 aa  76.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  24.42 
 
 
440 aa  73.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  25.35 
 
 
681 aa  71.2  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  22.88 
 
 
444 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  24.06 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04580  cytoplasm protein, putative  24.55 
 
 
1144 aa  66.6  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  25.55 
 
 
424 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.4 
 
 
734 aa  64.7  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.39 
 
 
734 aa  64.7  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  23.47 
 
 
468 aa  64.7  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.47 
 
 
765 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.8 
 
 
711 aa  63.9  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  33.33 
 
 
896 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4427  hypothetical protein  22.31 
 
 
901 aa  63.9  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  22.03 
 
 
509 aa  62  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  23.8 
 
 
509 aa  62.4  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.13 
 
 
623 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  22.95 
 
 
495 aa  60.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  22.19 
 
 
514 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  22.19 
 
 
514 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  20.84 
 
 
510 aa  60.1  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2768  hypothetical protein  23.19 
 
 
886 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.693852  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2813  glucosidase  29.91 
 
 
881 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.125423  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3432  glucosidase  30.71 
 
 
883 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3230  hypothetical protein  25 
 
 
891 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522879 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.21 
 
 
725 aa  60.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4938  glucosidase  23.6 
 
 
896 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0850212  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1861  hypothetical protein  30.58 
 
 
892 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507599  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17410  hypothetical protein  32.17 
 
 
912 aa  60.1  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.567848  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.82 
 
 
764 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1748  hypothetical protein  30.58 
 
 
911 aa  58.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0575728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.19 
 
 
708 aa  58.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3773  hypothetical protein  24.3 
 
 
887 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1943  hypothetical protein  28.7 
 
 
891 aa  57.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637433  normal  0.041134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  20.98 
 
 
914 aa  57.4  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.25 
 
 
741 aa  57.4  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.87 
 
 
700 aa  57.4  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87266  conserved hypothetical protein  22.39 
 
 
1047 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.483888  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  23.47 
 
 
441 aa  56.6  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1435  trehalase  30 
 
 
460 aa  55.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0656855  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6603  hypothetical protein  29.37 
 
 
914 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1574  glucosidase  26.4 
 
 
890 aa  55.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.786209  normal  0.991499 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  26.53 
 
 
729 aa  55.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.22 
 
 
736 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4437  hypothetical protein  28 
 
 
901 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.43496  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.4 
 
 
781 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500039 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06286  conserved hypothetical protein  28.07 
 
 
1036 aa  54.7  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931044  normal  0.440135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1812  hypothetical protein  27.35 
 
 
913 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.51 
 
 
720 aa  54.7  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.22 
 
 
734 aa  54.7  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0214  hypothetical protein  31.75 
 
 
933 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  26.32 
 
 
401 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6278  hypothetical protein  29.37 
 
 
913 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7096  hypothetical protein  31.75 
 
 
935 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.07 
 
 
733 aa  52.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2302  hypothetical protein  26.77 
 
 
903 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0370449  hitchhiker  0.000942014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2843  trehalase  23.23 
 
 
561 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2091  hypothetical protein  23.48 
 
 
917 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>