More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1442 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1442  type II secretion system protein E  100 
 
 		 346 aa  685    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0643  type II secretion system protein E  47.92 
 
 		 371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000183544  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  41.33 
 
 		 515 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  41.45 
 
 		 497 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  41.45 
 
 		 497 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  41.45 
 
 		 497 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  41.45 
 
 		 497 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  41.45 
 
 		 497 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  41.45 
 
 		 497 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  41.45 
 
 		 497 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  39.89 
 
 		 553 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  41.45 
 
 		 497 aa  262  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  40.75 
 
 		 522 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  40.87 
 
 		 498 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  40.87 
 
 		 499 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  40.87 
 
 		 499 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  40.87 
 
 		 499 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  40.87 
 
 		 499 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  40.87 
 
 		 499 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  40.58 
 
 		 499 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  36.66 
 
 		 585 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  40.46 
 
 		 495 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  36.66 
 
 		 585 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  38.14 
 
 		 469 aa  255  8e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  38.1 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  39.78 
 
 		 871 aa  253  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  44.33 
 
 		 585 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  38.14 
 
 		 469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  40.61 
 
 		 583 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  45.07 
 
 		 520 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  46.82 
 
 		 520 aa  252  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  44.48 
 
 		 580 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  44.36 
 
 		 574 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  38.92 
 
 		 570 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  44.48 
 
 		 567 aa  250  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  44.15 
 
 		 578 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  44.18 
 
 		 562 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  45.05 
 
 		 569 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  42.91 
 
 		 507 aa  249  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  44.49 
 
 		 557 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  38.11 
 
 		 471 aa  249  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  39.44 
 
 		 477 aa  249  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  42.49 
 
 		 579 aa  248  8e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  35.52 
 
 		 538 aa  248  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  45.15 
 
 		 557 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.04 
 
 		 556 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  46.72 
 
 		 563 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  45.09 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  44.63 
 
 		 566 aa  247  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  39.12 
 
 		 585 aa  247  2e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  45.32 
 
 		 521 aa  246  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  40.61 
 
 		 583 aa  246  4e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  43.66 
 
 		 569 aa  246  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  43.94 
 
 		 561 aa  246  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.4 
 
 		 558 aa  246  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.54 
 
 		 787 aa  245  8e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  44.9 
 
 		 533 aa  245  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5698  general secretory pathway protein E  38.81 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  44.26 
 
 		 518 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  43.82 
 
 		 558 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 513 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  44.33 
 
 		 563 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  43.66 
 
 		 587 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  44.26 
 
 		 518 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  44.29 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  36.42 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  37.71 
 
 		 546 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  43.21 
 
 		 463 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3085  type II secretion system protein E  41.39 
 
 		 560 aa  243  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136067 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  42.24 
 
 		 594 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  34.05 
 
 		 563 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  38.66 
 
 		 469 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  42.91 
 
 		 567 aa  242  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  46.27 
 
 		 566 aa  242  7e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  42.42 
 
 		 518 aa  242  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3232  type II secretion system protein E  39.86 
 
 		 545 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  42.86 
 
 		 573 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  36.62 
 
 		 570 aa  241  9e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  37.14 
 
 		 498 aa  241  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 560 aa  241  9e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  43.48 
 
 		 589 aa  242  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  40.69 
 
 		 497 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  38.57 
 
 		 520 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  38.57 
 
 		 520 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  36.66 
 
 		 575 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  40.69 
 
 		 497 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0916  general secretory pathway protein E  38.21 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  37.78 
 
 		 491 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  42.39 
 
 		 577 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  42.21 
 
 		 582 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  38.07 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  46.55 
 
 		 563 aa  241  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  42.05 
 
 		 576 aa  241  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  41.82 
 
 		 585 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  37.32 
 
 		 561 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  37.61 
 
 		 595 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  39.28 
 
 		 598 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  37.61 
 
 		 595 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  37.61 
 
 		 595 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  42.8 
 
 		 497 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>