More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2923 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  100 
 
 		 356 aa  715    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  48.05 
 
 		 338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  48.01 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  44.65 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  37.8 
 
 		 537 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  34.68 
 
 		 559 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  34.77 
 
 		 477 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  40.06 
 
 		 445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  37.94 
 
 		 364 aa  196  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  36.39 
 
 		 364 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.46 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  37.42 
 
 		 848 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  39.56 
 
 		 593 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  38.94 
 
 		 611 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  38.61 
 
 		 603 aa  176  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  34.17 
 
 		 487 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  33.97 
 
 		 543 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  33.97 
 
 		 543 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  32.9 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  32.29 
 
 		 578 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  30.68 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  34.75 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  35.92 
 
 		 493 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  37.18 
 
 		 547 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  32.03 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  32.93 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  31.47 
 
 		 543 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  33.53 
 
 		 378 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  30.7 
 
 		 446 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  33.64 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  35.06 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  33.22 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  30.4 
 
 		 446 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  32.62 
 
 		 510 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  33.13 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  33.77 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.78 
 
 		 392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  28.93 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  33.01 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  28.57 
 
 		 434 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  30.94 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  36.15 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  31.46 
 
 		 415 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  29.55 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  34.81 
 
 		 476 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  33.43 
 
 		 553 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  27.48 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  31.48 
 
 		 450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  32.62 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.05 
 
 		 505 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  30.56 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  29.3 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  30.63 
 
 		 496 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  32.09 
 
 		 601 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  30.61 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.57 
 
 		 421 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  30.3 
 
 		 371 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  26.25 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  34.87 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  29.28 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  30.25 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  29.57 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  29.18 
 
 		 413 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.18 
 
 		 422 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  28.32 
 
 		 416 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  29.18 
 
 		 421 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  30.96 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  29.18 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  32.29 
 
 		 349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  27.46 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  28.77 
 
 		 404 aa  126  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  32.74 
 
 		 529 aa  126  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  27.62 
 
 		 520 aa  126  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  29.65 
 
 		 595 aa  126  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  28.79 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  27.46 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  29.63 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.53 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  34.37 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  34.04 
 
 		 501 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  31.98 
 
 		 544 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  28.86 
 
 		 431 aa  123  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  33.77 
 
 		 497 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.32 
 
 		 681 aa  123  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  29.77 
 
 		 375 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  31.72 
 
 		 567 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  25.67 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  28.62 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  25.81 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  30.11 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  29.73 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  27.85 
 
 		 498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  32.13 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  27.85 
 
 		 498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  32.69 
 
 		 475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  25.35 
 
 		 481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  25.35 
 
 		 481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  30.58 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  25.35 
 
 		 481 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  30.56 
 
 		 526 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>