201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5757 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  36.88 
 
 		 1296 aa  768    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  46.74 
 
 		 1328 aa  1157    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  100 
 
 		 1363 aa  2789    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  33.33 
 
 		 1403 aa  296  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  34.75 
 
 		 2013 aa  251  9e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  33.45 
 
 		 1973 aa  238  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  37.61 
 
 		 1803 aa  231  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  35.1 
 
 		 1958 aa  229  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  34.3 
 
 		 1622 aa  228  8e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  36.85 
 
 		 2207 aa  227  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  36.18 
 
 		 2198 aa  225  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  34.15 
 
 		 1754 aa  225  4.9999999999999996e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  35.19 
 
 		 2204 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  35.65 
 
 		 2016 aa  224  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  36.26 
 
 		 2222 aa  223  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  37.25 
 
 		 2005 aa  222  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  31.65 
 
 		 1559 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  33.14 
 
 		 1867 aa  219  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  38.78 
 
 		 1958 aa  218  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  38.78 
 
 		 1950 aa  218  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  36.84 
 
 		 1980 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  35.32 
 
 		 1945 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  35.03 
 
 		 1983 aa  217  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  33 
 
 		 1822 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  34.57 
 
 		 2197 aa  215  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  33.21 
 
 		 1991 aa  214  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  29.54 
 
 		 1888 aa  213  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  33.48 
 
 		 2125 aa  212  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  33.48 
 
 		 2125 aa  212  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  33.26 
 
 		 1722 aa  210  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1575 aa  207  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  34.88 
 
 		 2002 aa  207  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  36.58 
 
 		 2759 aa  207  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  31.59 
 
 		 1986 aa  206  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  33.48 
 
 		 1854 aa  205  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  35.25 
 
 		 1959 aa  202  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  35.98 
 
 		 1838 aa  202  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1801 aa  201  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  33.93 
 
 		 1589 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1589 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 		 2101 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 		 2101 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  33.71 
 
 		 1589 aa  196  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  35.89 
 
 		 1367 aa  195  4e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 		 2098 aa  196  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  31.07 
 
 		 1822 aa  195  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 		 2104 aa  195  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  33.26 
 
 		 1877 aa  194  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  30.02 
 
 		 2123 aa  193  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  36.22 
 
 		 1823 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  33.84 
 
 		 2098 aa  192  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  32.13 
 
 		 1853 aa  192  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  38.06 
 
 		 1285 aa  190  1e-46  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  33.84 
 
 		 2098 aa  191  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  36.07 
 
 		 2045 aa  189  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1572 aa  188  7e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  36.24 
 
 		 1559 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  34.72 
 
 		 1593 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  34.05 
 
 		 1328 aa  186  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.12 
 
 		 1312 aa  184  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1904 aa  183  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  34.69 
 
 		 2096 aa  177  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  36.68 
 
 		 1861 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  33.64 
 
 		 1571 aa  173  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  31.6 
 
 		 1050 aa  140  2e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  28.99 
 
 		 903 aa  111  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  31.31 
 
 		 1557 aa  110  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  29.71 
 
 		 946 aa  107  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1413 aa  106  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  32.24 
 
 		 906 aa  104  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  27.12 
 
 		 905 aa  103  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1400 aa  102  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  28.19 
 
 		 1121 aa  102  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1407 aa  102  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  28.01 
 
 		 905 aa  101  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  26.64 
 
 		 1489 aa  100  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1506 aa  99.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  25.64 
 
 		 900 aa  99.8  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1392 aa  99.8  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  28.62 
 
 		 907 aa  99  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  27.91 
 
 		 905 aa  98.6  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  28.62 
 
 		 905 aa  98.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  24.79 
 
 		 1630 aa  97.8  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  28.62 
 
 		 905 aa  98.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  25.65 
 
 		 1490 aa  96.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  26.98 
 
 		 1622 aa  95.1  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  27.1 
 
 		 1790 aa  94.7  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1652 aa  92.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  28.19 
 
 		 908 aa  91.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  30.06 
 
 		 1629 aa  90.1  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1474 aa  89.7  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.5 
 
 		 629 aa  89.4  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1499 aa  89  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  26.33 
 
 		 1697 aa  88.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 		 1203 aa  86.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  29.49 
 
 		 1649 aa  85.5  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24380  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1670 aa  84  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694198  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  26.63 
 
 		 1410 aa  82.4  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  22.56 
 
 		 1412 aa  80.9  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  32.56 
 
 		 1523 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>