254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5485 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  100 
 
 		 561 aa  1166    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  41.92 
 
 		 518 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.95 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  30.64 
 
 		 371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.41 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  29.63 
 
 		 400 aa  124  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.37 
 
 		 367 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  30.86 
 
 		 676 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  28.27 
 
 		 422 aa  122  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.2 
 
 		 451 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  31.9 
 
 		 482 aa  117  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.91 
 
 		 455 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  30.12 
 
 		 2172 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  28.85 
 
 		 766 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.56 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.05 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  30.15 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.59 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  27.16 
 
 		 469 aa  104  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.39 
 
 		 427 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26 
 
 		 403 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  32.62 
 
 		 875 aa  96.3  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.65 
 
 		 520 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.96 
 
 		 392 aa  92  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.47 
 
 		 388 aa  89.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  28.19 
 
 		 419 aa  88.6  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  32.04 
 
 		 712 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.4 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 353 aa  83.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.32 
 
 		 570 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  29.5 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  27.93 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  40 
 
 		 999 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  40 
 
 		 999 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  40 
 
 		 999 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  32.5 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  35.61 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  26.96 
 
 		 585 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.27 
 
 		 809 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  24.65 
 
 		 892 aa  77.4  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  29.03 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.38 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.07 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.61 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  29.61 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  28.22 
 
 		 399 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  27.16 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  27.35 
 
 		 469 aa  70.1  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  27.8 
 
 		 748 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  27.67 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  30.33 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  25.28 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  26.19 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  26.92 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  24.05 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  30.36 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  37.5 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  30.52 
 
 		 381 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0136  hypothetical protein  25.86 
 
 		 719 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.73272  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  29.55 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  26.35 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  29.96 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  29.96 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  39.45 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  31.76 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  25.59 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  29.07 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  25.32 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  27.42 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  24.49 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  32.74 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  39.24 
 
 		 366 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  30.52 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  26.76 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  26.25 
 
 		 369 aa  62  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  24.58 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.91 
 
 		 729 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  23.67 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  29.82 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  27.01 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1958  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.61 
 
 		 497 aa  60.1  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.922706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  29.77 
 
 		 406 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  26.47 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1897  secretion protein HlyD  23.5 
 
 		 485 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  29.15 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  24.53 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  26.47 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  26.55 
 
 		 1029 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  26.64 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  24.53 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  26.29 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  24.32 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1523  soluble aldose sugar dehydrogenase  27.87 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  26.56 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  29.77 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  27.53 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  23.86 
 
 		 376 aa  57  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  27.31 
 
 		 391 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  30.68 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>