81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2969 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 261 aa  528  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.52 
 
 		 1274 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  29.71 
 
 		 1619 aa  92.4  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.2 
 
 		 428 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 		 898 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 890 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  27.63 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  29.43 
 
 		 871 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  29.34 
 
 		 900 aa  79.7  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  29.34 
 
 		 903 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.77 
 
 		 1343 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  27.98 
 
 		 1097 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  25.99 
 
 		 509 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.75 
 
 		 579 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 704 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.69 
 
 		 578 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.69 
 
 		 578 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 704 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.05 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.41 
 
 		 491 aa  66.2  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.43 
 
 		 1760 aa  65.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  26.01 
 
 		 510 aa  65.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.16 
 
 		 735 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.3 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.85 
 
 		 708 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.81 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.19 
 
 		 1686 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.42 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  24.23 
 
 		 509 aa  62.4  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.77 
 
 		 309 aa  62  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3217  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.69 
 
 		 531 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.86766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3116  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.77 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.21 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.8 
 
 		 1196 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27 
 
 		 795 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27 
 
 		 795 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.09 
 
 		 902 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.89 
 
 		 1088 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1503  diguanylate phosphodiesterase  27.31 
 
 		 731 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.293201  hitchhiker  0.000197979 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.36 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 		 1711 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.83 
 
 		 1004 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.05 
 
 		 729 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2823  hypothetical protein  26.17 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.605143  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  25 
 
 		 587 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.82 
 
 		 477 aa  55.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.22 
 
 		 830 aa  55.8  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.7 
 
 		 324 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.43 
 
 		 941 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  27.23 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 322 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.71 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.96 
 
 		 538 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  31.37 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.2 
 
 		 538 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.66 
 
 		 445 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.66 
 
 		 445 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  23.89 
 
 		 1160 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.1 
 
 		 561 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  29.18 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.94 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.4 
 
 		 1004 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 305 aa  49.3  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  23.95 
 
 		 781 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.78 
 
 		 1106 aa  48.9  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28 
 
 		 270 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6789  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.24 
 
 		 1554 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  23 
 
 		 1672 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.78 
 
 		 1316 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1604  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  31.08 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0721  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.19 
 
 		 696 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.19 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.97 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  23.53 
 
 		 1687 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  25.64 
 
 		 925 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.97 
 
 		 641 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3027  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.9 
 
 		 697 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438464  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.55 
 
 		 658 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.64 
 
 		 633 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.93 
 
 		 615 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>