More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08730 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  100 
 
 		 563 aa  1128    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  53.21 
 
 		 700 aa  557  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  43.27 
 
 		 544 aa  470  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  34.71 
 
 		 535 aa  334  3e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  31.18 
 
 		 517 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  30.13 
 
 		 657 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  30.26 
 
 		 674 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  29.82 
 
 		 552 aa  150  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  29.25 
 
 		 534 aa  147  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 		 621 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  29.09 
 
 		 526 aa  143  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  29.16 
 
 		 559 aa  143  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  25.66 
 
 		 1217 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  26.09 
 
 		 522 aa  140  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  27.62 
 
 		 627 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  24.57 
 
 		 521 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  29.13 
 
 		 918 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  25.17 
 
 		 610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  28.01 
 
 		 521 aa  135  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  29.72 
 
 		 532 aa  134  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  26.18 
 
 		 521 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  28.83 
 
 		 543 aa  133  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  28.54 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  26.62 
 
 		 580 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  26.68 
 
 		 899 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  25.8 
 
 		 521 aa  127  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  26.79 
 
 		 1219 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  24.57 
 
 		 534 aa  123  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  26.14 
 
 		 1219 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0885  integral membrane protein MviN  23.57 
 
 		 518 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000255547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  25.13 
 
 		 521 aa  120  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  25.5 
 
 		 534 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  27.07 
 
 		 530 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  27.35 
 
 		 568 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  26.44 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  22.49 
 
 		 512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  26.01 
 
 		 546 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  25.77 
 
 		 560 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  22.78 
 
 		 514 aa  115  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  25.59 
 
 		 521 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  24.17 
 
 		 539 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  26.68 
 
 		 530 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  24.65 
 
 		 523 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  25.77 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  26.62 
 
 		 517 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  27.42 
 
 		 552 aa  111  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  26.52 
 
 		 580 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  26.67 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  21.65 
 
 		 521 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  28.39 
 
 		 592 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  27.59 
 
 		 545 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  27.35 
 
 		 573 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  28.33 
 
 		 521 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  26.56 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  26.94 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  26.56 
 
 		 532 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  25.81 
 
 		 535 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  26.46 
 
 		 535 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  26.53 
 
 		 519 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  25.57 
 
 		 529 aa  104  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  25.35 
 
 		 614 aa  104  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  23.37 
 
 		 613 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  26.73 
 
 		 516 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  25.44 
 
 		 570 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  26.25 
 
 		 535 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  23.58 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  24.56 
 
 		 648 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  25.45 
 
 		 513 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  23.94 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  25.88 
 
 		 513 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  23.14 
 
 		 522 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  22.94 
 
 		 522 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 		 514 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  25.63 
 
 		 513 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  26.09 
 
 		 511 aa  101  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  26.58 
 
 		 516 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 512 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 		 495 aa  100  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  27.11 
 
 		 512 aa  99.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1370  integral membrane protein MviN  24.78 
 
 		 512 aa  99  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000411577  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  24.32 
 
 		 512 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  27.17 
 
 		 708 aa  99  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  23.91 
 
 		 523 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  23.48 
 
 		 534 aa  98.6  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  25.74 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  24.34 
 
 		 523 aa  98.2  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  27.3 
 
 		 522 aa  98.2  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  25.4 
 
 		 511 aa  98.2  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  24.61 
 
 		 517 aa  97.1  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  26.42 
 
 		 715 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2971  integral membrane protein MviN  25.23 
 
 		 525 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000053192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  25.32 
 
 		 521 aa  96.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  24.2 
 
 		 529 aa  96.3  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1776  integral membrane protein MviN  24.53 
 
 		 521 aa  96.3  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  22.94 
 
 		 541 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  23.59 
 
 		 521 aa  95.5  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>