175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3861 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  100 
 
 
415 aa  831    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  86.27 
 
 
415 aa  724    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  71.5 
 
 
418 aa  620  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  68.36 
 
 
416 aa  535  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  49.28 
 
 
412 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  47.06 
 
 
406 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  46.57 
 
 
406 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  45.83 
 
 
406 aa  358  9e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  47.68 
 
 
407 aa  355  6.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  48.18 
 
 
417 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  44.55 
 
 
412 aa  332  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  44.31 
 
 
412 aa  329  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  41.81 
 
 
416 aa  293  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  41.81 
 
 
411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  39.37 
 
 
454 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  36.97 
 
 
436 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  40.29 
 
 
430 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  37.59 
 
 
415 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  33.33 
 
 
426 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  33.73 
 
 
425 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  38.04 
 
 
388 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.68 
 
 
391 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.72 
 
 
394 aa  209  9e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  35.14 
 
 
389 aa  208  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  36.19 
 
 
385 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  33.17 
 
 
402 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  32.77 
 
 
421 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.68 
 
 
386 aa  193  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  31.18 
 
 
380 aa  192  7e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  30.87 
 
 
385 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  33.78 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  34.49 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  29.31 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  31.36 
 
 
339 aa  176  5e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  31.2 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  30.24 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  32.8 
 
 
409 aa  173  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  30.89 
 
 
406 aa  170  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  29.06 
 
 
408 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  30.71 
 
 
409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  28.82 
 
 
474 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  32.95 
 
 
380 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  32.51 
 
 
407 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  39.45 
 
 
269 aa  160  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  29.71 
 
 
412 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  29.77 
 
 
408 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  30.14 
 
 
388 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  30.87 
 
 
441 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  31.63 
 
 
388 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  28.69 
 
 
388 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  29 
 
 
384 aa  150  5e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  34.07 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  28.98 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  30.67 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  29.67 
 
 
390 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  29.91 
 
 
383 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  32.79 
 
 
392 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  31.49 
 
 
390 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  31.96 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  29.9 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  29.95 
 
 
413 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  29.83 
 
 
383 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  28.23 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  31.13 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  30.79 
 
 
424 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  31.07 
 
 
389 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  29.02 
 
 
387 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  28.21 
 
 
376 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  30.81 
 
 
389 aa  123  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  30.28 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  28.88 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1402  hypothetical protein  27.71 
 
 
425 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  27.55 
 
 
378 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.67 
 
 
259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  27.18 
 
 
402 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  26.29 
 
 
398 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  26.37 
 
 
419 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2916  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.9 
 
 
425 aa  103  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  29.92 
 
 
427 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  25.72 
 
 
379 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  25.97 
 
 
413 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.48 
 
 
376 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  31.43 
 
 
417 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  28.28 
 
 
426 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  26.2 
 
 
382 aa  99.8  8e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  26.48 
 
 
386 aa  99.4  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  25.13 
 
 
427 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  25.26 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  29.5 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  28.61 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  25.2 
 
 
378 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  29.49 
 
 
350 aa  94.4  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  25 
 
 
377 aa  94  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.73 
 
 
423 aa  93.6  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1156  hypothetical protein  28.74 
 
 
423 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  26.43 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  26.08 
 
 
395 aa  90.9  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  24.43 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  28.74 
 
 
229 aa  87.4  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  24.93 
 
 
382 aa  86.3  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>