207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3616 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 479 aa  974    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  31.89 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  42.21 
 
 		 412 aa  146  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.36 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  31.22 
 
 		 430 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.91 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  27.32 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.11 
 
 		 460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  31.11 
 
 		 472 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  37.39 
 
 		 459 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  32.84 
 
 		 602 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.74 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  28.35 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  31.4 
 
 		 615 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 		 505 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 		 419 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  28.78 
 
 		 610 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.95 
 
 		 588 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  27.14 
 
 		 575 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.9 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.14 
 
 		 575 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  31.35 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  30.61 
 
 		 593 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  30.61 
 
 		 598 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  30.69 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  31.5 
 
 		 640 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  29.07 
 
 		 686 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  27.2 
 
 		 490 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  32.34 
 
 		 642 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  32.34 
 
 		 627 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  31.68 
 
 		 642 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  32.34 
 
 		 642 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  29.68 
 
 		 625 aa  87  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  30.6 
 
 		 613 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  29.22 
 
 		 624 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  27 
 
 		 571 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  27.13 
 
 		 808 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  31.03 
 
 		 633 aa  84  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  30.6 
 
 		 480 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 		 651 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.76 
 
 		 621 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  28.92 
 
 		 651 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  28.29 
 
 		 566 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.34 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  26.56 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  27.02 
 
 		 612 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  31.96 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  26.74 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  26.55 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  27.53 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  27.73 
 
 		 625 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  28.93 
 
 		 639 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  28.06 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  29.56 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  27.01 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  26.62 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  29.29 
 
 		 551 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  29.58 
 
 		 792 aa  76.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  26.1 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 		 592 aa  74.3  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  29.49 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  28.86 
 
 		 654 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  26.05 
 
 		 555 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  25.25 
 
 		 592 aa  71.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.49 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.67 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  27.11 
 
 		 709 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.11 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.8 
 
 		 794 aa  70.1  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.3 
 
 		 791 aa  70.1  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  25.78 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  25.37 
 
 		 425 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  25.65 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  27.23 
 
 		 536 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  29.82 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  30.18 
 
 		 562 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  28.37 
 
 		 966 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4213  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  30.46 
 
 		 1188 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  26.87 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  27.83 
 
 		 859 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  28.14 
 
 		 708 aa  64.7  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  25.63 
 
 		 629 aa  64.3  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  28.25 
 
 		 761 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  26.61 
 
 		 613 aa  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  30.61 
 
 		 1446 aa  63.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  25.54 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.34 
 
 		 795 aa  63.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  23.74 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  27 
 
 		 795 aa  63.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.86 
 
 		 3027 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 		 847 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.06 
 
 		 723 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  27.17 
 
 		 851 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  26.59 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>