232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1987 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.12 
 
 
1032 aa  652    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
1064 aa  2174    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.35 
 
 
1032 aa  556  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  27.86 
 
 
882 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  28.21 
 
 
1165 aa  153  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  27.62 
 
 
1173 aa  153  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.78 
 
 
1197 aa  151  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  28.31 
 
 
1173 aa  140  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  26.02 
 
 
1051 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.57 
 
 
1166 aa  131  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  29.39 
 
 
874 aa  128  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.43 
 
 
1054 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  23.43 
 
 
1054 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.99 
 
 
1085 aa  111  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.33 
 
 
707 aa  110  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.97 
 
 
707 aa  104  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  26.67 
 
 
824 aa  104  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.61 
 
 
707 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24.83 
 
 
1053 aa  102  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.56 
 
 
694 aa  100  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.06 
 
 
747 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  25 
 
 
727 aa  99.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.61 
 
 
746 aa  97.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.84 
 
 
747 aa  97.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  24.66 
 
 
712 aa  96.3  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.16 
 
 
709 aa  95.5  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.94 
 
 
751 aa  95.1  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.59 
 
 
1465 aa  92.4  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.27 
 
 
715 aa  91.7  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  24.15 
 
 
726 aa  91.3  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.5 
 
 
791 aa  90.9  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.35 
 
 
700 aa  89.4  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  23.83 
 
 
808 aa  89  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  24.04 
 
 
693 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25 
 
 
868 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.06 
 
 
1056 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.42 
 
 
662 aa  85.9  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  23.46 
 
 
729 aa  84.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  23.19 
 
 
760 aa  83.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.77 
 
 
756 aa  82.8  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25 
 
 
799 aa  82.4  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  22.35 
 
 
723 aa  82.8  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0511  DEAD/DEAH box helicase  23.65 
 
 
869 aa  81.3  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396939  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.59 
 
 
739 aa  80.9  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25 
 
 
708 aa  80.9  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  24.09 
 
 
901 aa  79  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.75 
 
 
863 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.65 
 
 
706 aa  79.3  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  22.75 
 
 
863 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1150  DEAD/DEAH box helicase-like  24.65 
 
 
858 aa  79  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.794218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.71 
 
 
817 aa  74.7  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  24.65 
 
 
918 aa  74.7  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4464  DEAD/DEAH box helicase-like  25.19 
 
 
1187 aa  71.6  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 
893 aa  71.2  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.06 
 
 
894 aa  70.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  25.96 
 
 
908 aa  70.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  25.16 
 
 
908 aa  70.5  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  25.48 
 
 
908 aa  70.1  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.58 
 
 
988 aa  69.7  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.69 
 
 
1265 aa  69.7  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3891  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  24.25 
 
 
1216 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  24.77 
 
 
2015 aa  68.9  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1492  helicase domain protein  24.01 
 
 
758 aa  68.6  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.44 
 
 
710 aa  68.6  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  22.6 
 
 
906 aa  68.2  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  24.26 
 
 
906 aa  67.8  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.48 
 
 
729 aa  66.6  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  24.11 
 
 
936 aa  67  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.59 
 
 
856 aa  67  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00467654  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3576  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.97 
 
 
1048 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  31.9 
 
 
852 aa  66.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  28.21 
 
 
799 aa  66.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.03 
 
 
952 aa  66.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  24.29 
 
 
1767 aa  66.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  22.95 
 
 
402 aa  65.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3380  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.35 
 
 
1203 aa  64.7  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.04 
 
 
780 aa  64.3  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  23.46 
 
 
1942 aa  63.9  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.11 
 
 
1004 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  23.72 
 
 
1770 aa  63.5  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  21.3 
 
 
849 aa  63.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.34 
 
 
803 aa  63.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  24.22 
 
 
890 aa  63.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  31.9 
 
 
885 aa  62.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  25.29 
 
 
889 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.88 
 
 
837 aa  63.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.77 
 
 
762 aa  63.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2283  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.5 
 
 
1220 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5115  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  22.8 
 
 
1205 aa  62.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  23.31 
 
 
919 aa  62.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  24.6 
 
 
908 aa  62.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.51 
 
 
847 aa  62.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.51 
 
 
852 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.51 
 
 
852 aa  62.4  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.51 
 
 
852 aa  62.4  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.51 
 
 
851 aa  62  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  30.61 
 
 
877 aa  61.6  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.27 
 
 
996 aa  61.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.17 
 
 
856 aa  61.2  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.83 
 
 
853 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>