204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2440 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 135 aa  269  8.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  94.07 
 
 		 135 aa  256  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  69.63 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  68.89 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  64.44 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  61.48 
 
 		 135 aa  176  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  59.26 
 
 		 135 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  59.26 
 
 		 135 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  59.26 
 
 		 135 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  58.52 
 
 		 135 aa  151  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  51.11 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  45.59 
 
 		 136 aa  120  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  44.03 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  49.63 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  42.65 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  34.35 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  38.89 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  38.89 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  29.93 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  34.88 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  29.85 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  33.72 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  35.82 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  45.59 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  28.89 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  37.97 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  38.57 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  34.53 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  30.3 
 
 		 402 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  28.89 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  33.82 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  31.88 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  33.82 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 394 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  38.36 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  27.41 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2881  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  33.02 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3074  Endoribonuclease L-PSP  33.81 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2969  Endoribonuclease L-PSP  33.81 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3905  Endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0995322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  29.66 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  32.12 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  31.48 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  31.48 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  47.27 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>