More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1070 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 272 aa  536  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  64.04 
 
 		 230 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  51.03 
 
 		 245 aa  247  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  52.52 
 
 		 243 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  50.82 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  51.12 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  50.22 
 
 		 242 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  47.26 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 246 aa  221  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  50.21 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  47.58 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  48.02 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  45.61 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  45.7 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  46.98 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  46.09 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  50.45 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  46.85 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  50.22 
 
 		 248 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  48.46 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  45.31 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  48.17 
 
 		 278 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  49.11 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  47.58 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  48.85 
 
 		 258 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  45.42 
 
 		 275 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  45.74 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  46.26 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  45 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  47.71 
 
 		 275 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  42.66 
 
 		 224 aa  200  3e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  44.39 
 
 		 249 aa  198  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  48.23 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  44.25 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  45 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  38.86 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  43.24 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  50.56 
 
 		 209 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  47.57 
 
 		 203 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  42.99 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  42.04 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  37.92 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  44.98 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  41.41 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 226 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  38.75 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  40.09 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  38.64 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  38.01 
 
 		 225 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 196 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  36.2 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  40.1 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  39.8 
 
 		 223 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  32.27 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  34.07 
 
 		 241 aa  138  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  33.77 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 225 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  40.35 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0625  DNA repair protein RadC, putative  31.94 
 
 		 218 aa  130  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.42242  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1542  DNA repair protein RadC  48.51 
 
 		 162 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0270  DNA repair protein RadC  31.96 
 
 		 211 aa  123  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  35.1 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  34.76 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3721  DNA repair protein RadC  43.2 
 
 		 138 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0768638  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  34.11 
 
 		 233 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  33.17 
 
 		 224 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  33.64 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  34.56 
 
 		 226 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  32.69 
 
 		 224 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  33.81 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  34.11 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  32.04 
 
 		 225 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0979  DNA repair protein RadC  38.61 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  35.05 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2230  DNA repair protein RadC  38.61 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1139  DNA repair protein RadC  38.61 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1020  DNA repair protein RadC  38.61 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.569834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0781  DNA repair protein RadC  37.74 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0984  DNA repair protein RadC  38.61 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2646  DNA repair protein RadC  38.61 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2099  DNA repair protein RadC  38.61 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.208076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  33.48 
 
 		 224 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 225 aa  113  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  35.35 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  35.29 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>