More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2935 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  35.91 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  35.62 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  35.45 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  35.59 
 
 		 223 aa  154  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  36.82 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  35.62 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  36.62 
 
 		 275 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  33.92 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  34.55 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  37.09 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  37.09 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  36.62 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  34.74 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  34.27 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  34.27 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0270  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  38.53 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  35.68 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  33.78 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  36.62 
 
 		 278 aa  145  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  34.4 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  34.51 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  34.74 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  36.15 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  31.96 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  33.95 
 
 		 238 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  33.77 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  35 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  34.27 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  30.45 
 
 		 241 aa  141  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  35 
 
 		 249 aa  141  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 273 aa  141  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  31.02 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  34.27 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  36.07 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  34.82 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  34.27 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  33.03 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  30.77 
 
 		 254 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  30.56 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  31.94 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  31.92 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  31.65 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  31.34 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  32.71 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  30.77 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  31.78 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  32.87 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  31.48 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  36.62 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  32.02 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  31.78 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  32.73 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  29.68 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  32.87 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  32.26 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 261 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  34.74 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  34.27 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00049  DNA repair protein RadC  34.56 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00103184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  30.56 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  31.16 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  31.16 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  31.02 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  31.02 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  34.09 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  29.96 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  31.05 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0327  DNA repair protein RadC  31.34 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000320995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  28.7 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  31.8 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  33.03 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3773  DNA repair protein RadC  31.74 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  29.63 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  29.63 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  29.63 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0186  DNA repair protein RadC  29.63 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.953222  hitchhiker  0.000000662884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  31.92 
 
 		 224 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  31.28 
 
 		 221 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  30.99 
 
 		 221 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  30.7 
 
 		 224 aa  124  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  30.99 
 
 		 221 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  30.99 
 
 		 224 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  30.99 
 
 		 221 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  30.99 
 
 		 221 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  31.92 
 
 		 222 aa  124  9e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  32.72 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2553  DNA repair protein RadC  32.37 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  31.11 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  30.99 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  31.02 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5194  DNA repair protein RadC  29.63 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0102732  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  28.64 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  30.99 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>