More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2621 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 246 aa  494  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  59.73 
 
 		 255 aa  271  6e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  51.38 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  52.38 
 
 		 249 aa  234  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  54.46 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  54.46 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  49.79 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  52.34 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  48.75 
 
 		 263 aa  228  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  53.27 
 
 		 275 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  50.89 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  52.8 
 
 		 275 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  51.4 
 
 		 242 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  48.32 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  45.78 
 
 		 245 aa  224  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  53.27 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  50.69 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  49.53 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  51.16 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  53.27 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 272 aa  221  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  49.54 
 
 		 230 aa  221  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  52.34 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  50.47 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  50.23 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  50.23 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  46.7 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  51.07 
 
 		 261 aa  214  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  50.47 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  51.54 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  49.53 
 
 		 239 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  46.73 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  47.56 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  47.98 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  45.79 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  43.3 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  40.37 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  44.13 
 
 		 273 aa  188  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  46.7 
 
 		 196 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  51.16 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  47.87 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  40.64 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  38.89 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  37.09 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  42.01 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  38.56 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  40.52 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  35.29 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  43.3 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  41.46 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  45.35 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  33.79 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0210  DNA repair protein RadC  36.13 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567078  normal  0.0524973 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3721  DNA repair protein RadC  46.56 
 
 		 138 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0768638  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  39.44 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  39.56 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  38.86 
 
 		 225 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5335  DNA repair protein RadC  39.25 
 
 		 226 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550179 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  38.61 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  37.91 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  36.45 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  38.46 
 
 		 257 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  37.74 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0186  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.953222  hitchhiker  0.000000662884 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  34.7 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  39.25 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0794  DNA repair protein RadC  39.44 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.132133 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  34.58 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  39.72 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  37.8 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  34.88 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  35.38 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5284  DNA repair protein RadC  36.45 
 
 		 226 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  34.91 
 
 		 224 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5194  DNA repair protein RadC  36.45 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0102732  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  34.91 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0491  DNA repair protein RadC  36.54 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  35.38 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  36.87 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  34.6 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  35.38 
 
 		 221 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  32.29 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  33.49 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  33.49 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  33.49 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  35.85 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  35.85 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>