More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0257 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  51.35 
 
 		 223 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  48.46 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  40.68 
 
 		 271 aa  174  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  39.5 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  43.84 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  38.79 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  38.05 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  39.09 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  39.13 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  38.82 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  38.36 
 
 		 246 aa  151  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  40.38 
 
 		 275 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  36.53 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  39.81 
 
 		 275 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  36.53 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  39.27 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  37.38 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  35.4 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  37.86 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  35.92 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  38.97 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  39.42 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  37.38 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  36.99 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  34.07 
 
 		 272 aa  138  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 241 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  38.36 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  34.84 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  36.7 
 
 		 263 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  34.63 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  34.7 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  38.83 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  36.56 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  30.45 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  34.4 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  36.28 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  32.17 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  34.84 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  38.83 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  34.88 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  38.83 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  33.03 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  32.9 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  36.28 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  38.83 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  34.26 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  37.33 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  34.27 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  33.78 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  34.47 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0376  DNA repair protein RadC  35.68 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000147811  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  32.87 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  32.27 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3828  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 225 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.760529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0781  DNA repair protein RadC  35.94 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  34.84 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  31.65 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  30.05 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1020  DNA repair protein RadC  35.02 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.569834  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2230  DNA repair protein RadC  35.02 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  34.27 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1139  DNA repair protein RadC  35.02 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0984  DNA repair protein RadC  35.02 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  30.05 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  35.19 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0979  DNA repair protein RadC  35.02 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2099  DNA repair protein RadC  35.02 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.208076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  30.05 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2646  DNA repair protein RadC  35.02 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  34.42 
 
 		 224 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0402  DNA repair protein RadC  35.21 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000130829  hitchhiker  0.000000000166485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  31.48 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0377  DNA repair protein RadC  35.21 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000108999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4248  DNA repair protein RadC  34.74 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  38.81 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0388  DNA repair protein RadC  35.21 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000131294  hitchhiker  0.0000732355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  31.94 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  31.92 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  29.58 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  29.58 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  29.58 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  29.58 
 
 		 214 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>