More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1454 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 251 aa  517  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  71.93 
 
 		 278 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  68.33 
 
 		 236 aa  333  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  69.23 
 
 		 254 aa  333  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  69.68 
 
 		 260 aa  331  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  69.06 
 
 		 275 aa  327  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  69.06 
 
 		 275 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  66.97 
 
 		 242 aa  324  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  64.8 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  67.97 
 
 		 250 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  69.23 
 
 		 239 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  68.61 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  65.31 
 
 		 246 aa  315  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  66.67 
 
 		 239 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  65.61 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  64.71 
 
 		 242 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  63.8 
 
 		 246 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  61.09 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  55.74 
 
 		 241 aa  291  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  61.99 
 
 		 238 aa  291  9e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  61.09 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  56.54 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  60.09 
 
 		 230 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  57.26 
 
 		 248 aa  275  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  58.37 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  57.01 
 
 		 254 aa  268  8e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  57.14 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  54.07 
 
 		 258 aa  262  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  53.39 
 
 		 254 aa  260  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  58.37 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  63.64 
 
 		 203 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  54.3 
 
 		 243 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  54.55 
 
 		 226 aa  250  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  58.76 
 
 		 223 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  60.5 
 
 		 209 aa  241  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  50.68 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  52.75 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  50.47 
 
 		 246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  46.98 
 
 		 272 aa  215  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  45.87 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  46.29 
 
 		 230 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  57.47 
 
 		 196 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 230 aa  192  6e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  50.7 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  40.64 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  45.5 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  41.51 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  40.72 
 
 		 226 aa  168  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  42.47 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3721  DNA repair protein RadC  55.91 
 
 		 138 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0768638  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  42.23 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  38.98 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  40.72 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  40.85 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  39.39 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  44.62 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  36.92 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  39.27 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1542  DNA repair protein RadC  51.15 
 
 		 162 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  44.32 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0210  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567078  normal  0.0524973 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  37.26 
 
 		 236 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  38.31 
 
 		 206 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  37.38 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  42.2 
 
 		 225 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  38.76 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  35.92 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  35.92 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  35.92 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  36.41 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  35.92 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  35.92 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  36.92 
 
 		 224 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  36.63 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  37.31 
 
 		 224 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  35.44 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  38.19 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  38.61 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  36.41 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  34.93 
 
 		 241 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  34.95 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  34.95 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  34.95 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  34.95 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  34.95 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  34.95 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  34.93 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  34.95 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  37.19 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  36.84 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  35.38 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  36.18 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>