More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3721 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3721  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 138 aa  285  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0768638  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  67.42 
 
 		 273 aa  201  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  65.91 
 
 		 254 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  60.61 
 
 		 257 aa  189  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  62.6 
 
 		 258 aa  189  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  64.39 
 
 		 261 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  62.88 
 
 		 230 aa  186  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  62.88 
 
 		 254 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  59.85 
 
 		 263 aa  177  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  55.3 
 
 		 249 aa  172  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  60.47 
 
 		 226 aa  171  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  56.25 
 
 		 249 aa  168  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  56.69 
 
 		 246 aa  167  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  52.67 
 
 		 243 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  55.12 
 
 		 275 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  55.12 
 
 		 275 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  55.91 
 
 		 251 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  54.33 
 
 		 260 aa  160  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  57.48 
 
 		 250 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  57.48 
 
 		 239 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  60 
 
 		 253 aa  158  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  55.47 
 
 		 239 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  55.91 
 
 		 242 aa  157  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  51.97 
 
 		 278 aa  157  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  48.85 
 
 		 265 aa  156  9e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  51.91 
 
 		 236 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  51.97 
 
 		 242 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  68.32 
 
 		 223 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  52.76 
 
 		 247 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  54.33 
 
 		 238 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  51.18 
 
 		 254 aa  150  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  51.18 
 
 		 241 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  53.97 
 
 		 246 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  52.76 
 
 		 248 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  51.97 
 
 		 248 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  53.72 
 
 		 248 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  46.56 
 
 		 246 aa  140  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  48.09 
 
 		 255 aa  140  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  45.04 
 
 		 230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  48.85 
 
 		 223 aa  137  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  45.8 
 
 		 221 aa  134  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1542  DNA repair protein RadC  51.24 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  43.94 
 
 		 245 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  43.2 
 
 		 272 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  64.71 
 
 		 209 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  59.3 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  38.1 
 
 		 230 aa  113  7.999999999999999e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  38.21 
 
 		 224 aa  111  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  38.21 
 
 		 230 aa  111  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3359  DNA repair protein RadC  45 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2488  DNA repair protein RadC  43.59 
 
 		 354 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386498  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  46.9 
 
 		 227 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  55.29 
 
 		 203 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  45.13 
 
 		 221 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  45.76 
 
 		 221 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  44.25 
 
 		 222 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  44.25 
 
 		 222 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000803057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  44.25 
 
 		 222 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  39.37 
 
 		 228 aa  108  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  46.49 
 
 		 227 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0692  DNA repair protein RadC  42.75 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1032  DNA repair protein RadC  42.5 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  42.31 
 
 		 221 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0308  RadC family DNA repair protein  43.36 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00747747  hitchhiker  0.00434898 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  46.02 
 
 		 222 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  41.54 
 
 		 221 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  46.02 
 
 		 222 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  45.28 
 
 		 228 aa  104  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4745  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0218895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  46.49 
 
 		 224 aa  103  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  44.8 
 
 		 234 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  46.02 
 
 		 222 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  46.02 
 
 		 222 aa  103  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  43.51 
 
 		 224 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  46.02 
 
 		 222 aa  103  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  46.02 
 
 		 222 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  43.41 
 
 		 224 aa  103  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  46.02 
 
 		 222 aa  103  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  42.75 
 
 		 224 aa  103  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  46.02 
 
 		 214 aa  103  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  46.02 
 
 		 222 aa  103  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  44.27 
 
 		 224 aa  103  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0270  DNA repair protein RadC  38.33 
 
 		 211 aa  103  9e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  41.32 
 
 		 236 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1383  putative DNA repair protein RadC  41.98 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  39.69 
 
 		 253 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08165  DNA repair protein RadC  44.53 
 
 		 305 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  46.02 
 
 		 224 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  38.93 
 
 		 232 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  42.75 
 
 		 224 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1655  DNA repair protein RadC  46.3 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153921  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  43.36 
 
 		 221 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3209  RadC family DNA repair protein  46.3 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3410  RadC family DNA repair protein  46.3 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  43.36 
 
 		 221 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1125  DNA repair protein, RadC family  46.3 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4680  DNA repair protein, RadC family  46.3 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2396  DNA repair protein  43.44 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1062  RadC family DNA repair protein  46.3 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.130862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4804  RadC family DNA repair protein  46.3 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>