More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1246 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  90.57 
 
 		 249 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  71.1 
 
 		 275 aa  315  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  71.3 
 
 		 275 aa  315  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  65.31 
 
 		 251 aa  315  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  68.95 
 
 		 278 aa  310  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  65.3 
 
 		 236 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  61.16 
 
 		 254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  60.41 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  65.6 
 
 		 242 aa  298  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  67.58 
 
 		 260 aa  297  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  65.14 
 
 		 247 aa  295  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  63.3 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  64.52 
 
 		 238 aa  285  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  60.27 
 
 		 230 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  58.95 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  61.54 
 
 		 239 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  59.24 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  62.5 
 
 		 250 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  61.57 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  57.14 
 
 		 248 aa  274  8e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  60.25 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  61.29 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  60.55 
 
 		 263 aa  261  6e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  57.87 
 
 		 257 aa  261  6.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  53.78 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  55.71 
 
 		 273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  57.55 
 
 		 258 aa  244  6.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  53.19 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  54.67 
 
 		 254 aa  241  7e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  55.46 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  64.32 
 
 		 209 aa  238  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  53.92 
 
 		 226 aa  238  9e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  54.46 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  63.89 
 
 		 203 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  55.4 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  54.55 
 
 		 223 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  46.73 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 272 aa  195  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  49.25 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  42.47 
 
 		 228 aa  189  5e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  43.78 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  52.87 
 
 		 196 aa  185  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  52.79 
 
 		 253 aa  184  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  45.5 
 
 		 223 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 230 aa  176  4e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  41.31 
 
 		 230 aa  176  4e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  40.45 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 224 aa  172  5.999999999999999e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  40.45 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3721  DNA repair protein RadC  56.69 
 
 		 138 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0768638  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  43.52 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  41.51 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  44.92 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  38.5 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  38.03 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  41.35 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  38.83 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  42.2 
 
 		 225 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  37.26 
 
 		 272 aa  148  7e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  45.51 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  36.45 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1542  DNA repair protein RadC  51.69 
 
 		 162 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  35 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 227 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  36.11 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0210  DNA repair protein RadC  37.9 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567078  normal  0.0524973 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  36.06 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  34.93 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  34.86 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  33.77 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  36.11 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  35.32 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  33.02 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  36.98 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0326  DNA repair protein RadC  34.13 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0376  DNA repair protein RadC  34.62 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000147811  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  37.57 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0377  DNA repair protein RadC  34.62 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000108999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0388  DNA repair protein RadC  34.62 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000131294  hitchhiker  0.0000732355 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0402  DNA repair protein RadC  34.62 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000130829  hitchhiker  0.000000000166485 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  36.74 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  34.58 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  35.6 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00049  DNA repair protein RadC  32.57 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00103184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0186  DNA repair protein RadC  34.74 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.953222  hitchhiker  0.000000662884 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  34.72 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0462  DNA repair protein RadC  34.62 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000108191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  33.03 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5284  DNA repair protein RadC  35.16 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  34.2 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5194  DNA repair protein RadC  35.16 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0102732  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  31.98 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  38.05 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>