More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3340 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  64.6 
 
 		 230 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  66.22 
 
 		 227 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  61.82 
 
 		 226 aa  280  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  60.91 
 
 		 226 aa  275  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  62.26 
 
 		 227 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  52.36 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  57.73 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  57.73 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  57.73 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  57.27 
 
 		 225 aa  258  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  57.27 
 
 		 225 aa  258  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  57.27 
 
 		 225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  56.36 
 
 		 225 aa  258  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  56.82 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  56.36 
 
 		 225 aa  254  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  60 
 
 		 229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  53.71 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  53.71 
 
 		 235 aa  242  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  53.98 
 
 		 228 aa  238  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  51.1 
 
 		 229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  54.42 
 
 		 227 aa  232  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  52.42 
 
 		 227 aa  231  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  53.4 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  47.79 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  49.78 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  50.67 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  50.7 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  49.11 
 
 		 227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  44.93 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  46.43 
 
 		 229 aa  211  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  48.66 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  46.22 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  48.43 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  47.56 
 
 		 229 aa  208  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 229 aa  207  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  45.29 
 
 		 229 aa  205  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  46.64 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 233 aa  203  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  47.09 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  44.25 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  47.11 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  45.81 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  47.14 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  46.85 
 
 		 222 aa  198  7e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  44.39 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  46.26 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  59.49 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  43.05 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  52.25 
 
 		 186 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  50.57 
 
 		 185 aa  185  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  43.87 
 
 		 223 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  41.26 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  41.52 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  41.26 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  48.33 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  44.59 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  40.81 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  41.26 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  40.18 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 245 aa  178  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  41.59 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  39.65 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  41.26 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  42.41 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  41.26 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  43.86 
 
 		 222 aa  174  8e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  43.3 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  38.57 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  42.11 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  42.47 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  41.7 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  43.58 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  43.11 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  40.36 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  41.01 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  40.72 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 224 aa  168  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 224 aa  168  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  39.47 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  42.38 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  39.62 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  37.05 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  43.04 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  41.4 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  42.72 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  42.25 
 
 		 233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0327  DNA repair protein RadC  37.89 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000320995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  39.29 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3828  DNA repair protein RadC  36.16 
 
 		 225 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.760529  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  40.61 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>