More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3086 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  73.78 
 
 		 225 aa  329  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  65.33 
 
 		 225 aa  308  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  57.67 
 
 		 229 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  48.88 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  50.91 
 
 		 226 aa  217  8.999999999999998e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  43.44 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  45.25 
 
 		 249 aa  180  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  45.25 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  44.8 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  44.44 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  44.14 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  43.44 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  43.24 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  43.52 
 
 		 246 aa  174  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  43.89 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  43.98 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  39.17 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  41.7 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  41.26 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  43.5 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  41.18 
 
 		 243 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  44.14 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  44.14 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  43.69 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  39.09 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  43.05 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  42.49 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  43.12 
 
 		 250 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  42.2 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 263 aa  151  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 251 aa  151  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  38.84 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  38.07 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 273 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  38.07 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  38.53 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  39.56 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  38.71 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 272 aa  142  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  38.61 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  36.56 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  39.44 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  36.65 
 
 		 257 aa  138  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  40.55 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  39.19 
 
 		 245 aa  136  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  38.14 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  38.03 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  36.05 
 
 		 231 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  37.05 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0979  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  38.03 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0781  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  38.43 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0984  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2230  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1139  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2099  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.208076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  36.15 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  41.4 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1020  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.569834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2646  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1654  DNA repair protein RadC  36.4 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794365  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  38.89 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  38.03 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  37.21 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  42.7 
 
 		 209 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  38.86 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3773  DNA repair protein RadC  36.84 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  33.03 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0794  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.132133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  37.21 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  39.06 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  36.28 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  35.56 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  36.41 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  35.19 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  35.56 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  37.21 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  36.07 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  38.73 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  32.42 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  37.09 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  37.09 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  37.09 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  36.62 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  36.62 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  41.95 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>