More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0363 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 230 aa  470  1e-132  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  83.91 
 
 		 230 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  54.13 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  43.58 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  44.04 
 
 		 254 aa  205  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  44.95 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 243 aa  198  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  42.66 
 
 		 278 aa  197  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  44.13 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  43.12 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  43.12 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  39.17 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  43.12 
 
 		 241 aa  194  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  40.37 
 
 		 246 aa  194  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  38.86 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  41.74 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  41.74 
 
 		 236 aa  191  6e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  41.26 
 
 		 275 aa  191  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  41.74 
 
 		 247 aa  191  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  40.51 
 
 		 265 aa  188  5e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  39.63 
 
 		 254 aa  187  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  42.72 
 
 		 260 aa  187  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  40.81 
 
 		 275 aa  187  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  42.66 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  42.01 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  41.01 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 245 aa  184  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  42.2 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  37.79 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  41.31 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  37.33 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  38.53 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  38.25 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  43.86 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0625  DNA repair protein RadC, putative  36.11 
 
 		 218 aa  164  8e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.42242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  38.53 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  38.71 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 225 aa  158  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  36.2 
 
 		 275 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  36.82 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  39.89 
 
 		 196 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  36.26 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  35.32 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  35.62 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  30.8 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  32.39 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  36.57 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  32.39 
 
 		 224 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  36.14 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  38.53 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  32.6 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  32.39 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  33.98 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  33.5 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  33.02 
 
 		 228 aa  134  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  34.11 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  32.11 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  33.64 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  32.17 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  33.49 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  31.55 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  31.55 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  31.55 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  31.55 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  37.21 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  30.48 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  31.55 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  31.75 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  30.88 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  33.17 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  31.88 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0781  DNA repair protein RadC  33.5 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2646  DNA repair protein RadC  33.5 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2230  DNA repair protein RadC  33.5 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0984  DNA repair protein RadC  33.5 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1139  DNA repair protein RadC  33.5 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  32.56 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1020  DNA repair protein RadC  33.5 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.569834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2099  DNA repair protein RadC  33.5 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.208076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0979  DNA repair protein RadC  33.5 
 
 		 278 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  31.67 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  32.11 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  30.23 
 
 		 257 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  31.34 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  34.27 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  31.16 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  31.55 
 
 		 224 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  31.55 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>