More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0208 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 221 aa  433  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  45.5 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  46.8 
 
 		 263 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  46.43 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  45.85 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  45.67 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  44.02 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  42.93 
 
 		 275 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  42.16 
 
 		 275 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  43.63 
 
 		 251 aa  158  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  44.39 
 
 		 249 aa  158  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  42.11 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  45 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  44 
 
 		 258 aa  157  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  46.88 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  44.17 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  40.69 
 
 		 265 aa  155  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  42.5 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  44.61 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  42 
 
 		 239 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  42.47 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  42.11 
 
 		 254 aa  151  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  41.7 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  40.98 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  41.35 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  44.09 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  41 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  44.09 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  40.98 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  47.19 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  40.49 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  46.04 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  40.2 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  40.87 
 
 		 238 aa  141  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  39.62 
 
 		 245 aa  141  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  41.04 
 
 		 273 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  43.63 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  41.46 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  38.81 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3721  DNA repair protein RadC  45.8 
 
 		 138 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0768638  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  45.93 
 
 		 223 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  37.38 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  33.84 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  48.46 
 
 		 196 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1542  DNA repair protein RadC  46.88 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  37.75 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  31 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  33.7 
 
 		 228 aa  118  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  36.54 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  38.61 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  40.22 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  33.66 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  37.2 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  31.86 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  32.85 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  36.27 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  36.5 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  36.63 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  35.75 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  34.5 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  32.8 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  34.83 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  44.93 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2488  DNA repair protein RadC  38.71 
 
 		 354 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386498  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  34.16 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  33.17 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  32.31 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  46.08 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  36.22 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  30.88 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  44.2 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  33.17 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  34.39 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  31.73 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  33.83 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2695  DNA repair protein RadC  41.01 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  31.73 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  36.07 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  36.23 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1654  DNA repair protein RadC  37.17 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794365  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  35.19 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  31.73 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  31.73 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  31.73 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  31.73 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  32.97 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  31.73 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  33.82 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  31.05 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  31.73 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  31.73 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>