More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0720 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 273 aa  560  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  57.81 
 
 		 257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  61.75 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  61.71 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  55.83 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  59.46 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  60.73 
 
 		 261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  55.96 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  55.45 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  55.71 
 
 		 246 aa  252  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  54.13 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  53.64 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  53.64 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  52 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  52.73 
 
 		 226 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  51.56 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  53.46 
 
 		 247 aa  242  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  60.2 
 
 		 223 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  51.36 
 
 		 242 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  52.5 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  52.53 
 
 		 242 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  53.24 
 
 		 260 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  50.68 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  53 
 
 		 248 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  52.38 
 
 		 243 aa  235  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  53 
 
 		 248 aa  235  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  49.31 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  50.45 
 
 		 238 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  50.45 
 
 		 254 aa  232  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  53.18 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  52.27 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  52.53 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  52.73 
 
 		 239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3721  DNA repair protein RadC  67.42 
 
 		 138 aa  201  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0768638  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  52.91 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  45.54 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  52.57 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  41.22 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  44.13 
 
 		 246 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  42.99 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  47.96 
 
 		 196 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  43.93 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  38.53 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  45.45 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  40.36 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  38.21 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  40.65 
 
 		 223 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 225 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 225 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1542  DNA repair protein RadC  52.46 
 
 		 162 aa  138  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 227 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  37.33 
 
 		 225 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  40.36 
 
 		 221 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  34.3 
 
 		 224 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  34.86 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  33.49 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  35.21 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  37.02 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  39.89 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  33.94 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  33.5 
 
 		 221 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  33.64 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  35.41 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  34.43 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0210  DNA repair protein RadC  34.17 
 
 		 244 aa  123  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567078  normal  0.0524973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  32.55 
 
 		 232 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  33.8 
 
 		 224 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  32.04 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  32.04 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  32.04 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000803057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  33.17 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  34.84 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  33.98 
 
 		 224 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 224 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  31.92 
 
 		 224 aa  119  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  32.7 
 
 		 227 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  33.8 
 
 		 224 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00049  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00103184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  31.58 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  32.88 
 
 		 226 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  34.45 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  34.47 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 224 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  33.01 
 
 		 224 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  32.52 
 
 		 221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  34.72 
 
 		 234 aa  115  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  32.52 
 
 		 222 aa  115  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  30.52 
 
 		 221 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0385  DNA repair protein RadC  31.92 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00103198  hitchhiker  0.000000153707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  34.47 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0376  DNA repair protein RadC  31.92 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  32.04 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0327  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000320995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>