More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0357 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  54.13 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  52.02 
 
 		 230 aa  255  5e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  42.66 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  42.92 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  40.27 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  40.37 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 242 aa  191  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  41.74 
 
 		 254 aa  191  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  40.81 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 254 aa  188  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  38.99 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  37.84 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 246 aa  184  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  38.07 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  40.37 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  39.01 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  41.07 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  40.38 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  38.99 
 
 		 278 aa  178  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0625  DNA repair protein RadC, putative  35.71 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.42242  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  36.77 
 
 		 275 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  37.22 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  40.85 
 
 		 226 aa  173  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  36.57 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  40.41 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  38.81 
 
 		 261 aa  167  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  38.07 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  40.91 
 
 		 203 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  40.23 
 
 		 196 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  36.28 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  39.18 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  36.24 
 
 		 272 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  36.87 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  34.98 
 
 		 271 aa  135  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  32.39 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  36.53 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  34.26 
 
 		 275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  33.01 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  32.04 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  33.03 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  32.52 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  31.13 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  30.59 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  32.54 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  29.25 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  31.25 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  31.31 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2230  DNA repair protein RadC  30.29 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1139  DNA repair protein RadC  30.29 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0984  DNA repair protein RadC  30.29 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2646  DNA repair protein RadC  30.29 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2099  DNA repair protein RadC  30.29 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.208076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1020  DNA repair protein RadC  30.29 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.569834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0979  DNA repair protein RadC  30.29 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  29.91 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0781  DNA repair protein RadC  29.33 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0257  DNA repair protein RadC, truncation  53 
 
 		 99 aa  116  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.784842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  31.4 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  27.83 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  27.83 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  30.23 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  31.16 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  31.16 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  31.16 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  28.84 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2419  DNA repair protein RadC  31.75 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  hitchhiker  0.00254058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2548  DNA repair protein RadC  31.75 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  29.28 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  31.58 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  31.16 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  29.33 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  30.23 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  30.88 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0695  DNA repair protein RadC  34.08 
 
 		 222 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.63774 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3721  DNA repair protein RadC  38.21 
 
 		 138 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0768638  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  32.21 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  27.1 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  28.17 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>