More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0257 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0257  DNA repair protein RadC, truncation  100 
 
 		 99 aa  203  7e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.784842  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0625  DNA repair protein RadC, putative  60.61 
 
 		 218 aa  137  4.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.42242  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  53 
 
 		 224 aa  116  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  47.96 
 
 		 230 aa  102  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  48.98 
 
 		 230 aa  98.2  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0270  DNA repair protein RadC  46.94 
 
 		 211 aa  97.4  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 221 aa  90.9  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  42.27 
 
 		 234 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  43.43 
 
 		 255 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  40.4 
 
 		 246 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  45.92 
 
 		 226 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 221 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 221 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4804  RadC family DNA repair protein  37.37 
 
 		 158 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3410  RadC family DNA repair protein  37.37 
 
 		 158 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4680  DNA repair protein, RadC family  37.37 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3209  RadC family DNA repair protein  37.37 
 
 		 158 aa  87  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3350  RadC family DNA repair protein  38.38 
 
 		 158 aa  87  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1402  DNA repair protein, RadC family  37.37 
 
 		 158 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0957622 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 221 aa  86.7  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1655  DNA repair protein RadC  37.37 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1125  DNA repair protein, RadC family  37.37 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  41.84 
 
 		 225 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  41.24 
 
 		 228 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  44.44 
 
 		 254 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2855  DNA repair protein, RadC family  37.37 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  43 
 
 		 272 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2246  RadC family DNA repair protein  37.37 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 222 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 238 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 222 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  39.39 
 
 		 243 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  39.39 
 
 		 221 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  41 
 
 		 215 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 238 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 222 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000803057  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  41 
 
 		 222 aa  85.5  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1252  DNA repair protein RadC  40.82 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4896  RadC family DNA repair protein  37.37 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4033  DNA repair protein RadC  39.8 
 
 		 225 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1062  RadC family DNA repair protein  37.37 
 
 		 158 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.130862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  40.82 
 
 		 244 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 227 aa  84.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0735  DNA repair protein RadC  43.53 
 
 		 227 aa  84.7  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  39.8 
 
 		 222 aa  85.1  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 224 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  40.21 
 
 		 224 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 224 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  42.27 
 
 		 224 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  41.24 
 
 		 223 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  43.43 
 
 		 249 aa  84  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  44.68 
 
 		 247 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3359  DNA repair protein RadC  37.37 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3538  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 169 aa  83.6  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  43.62 
 
 		 242 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  40.4 
 
 		 253 aa  83.6  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2374  DNA repair protein RadC  40.21 
 
 		 165 aa  83.6  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2620  hypothetical protein  38.78 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1654  DNA repair protein RadC  37.76 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794365  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0803  DNA repair protein, RadC-like  44.33 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  39.18 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  43.33 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  42.42 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  37.89 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  39.18 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0946  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0625  DNA repair protein RadC  40.21 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  38.14 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  41.24 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2092  DNA repair protein RadC  46.25 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  42.42 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2396  DNA repair protein  38.78 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2347  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00287634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3048  DNA repair protein RadC  46.99 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000891178  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  39.18 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  37.11 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  37.11 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2319  DNA repair protein RadC  40.82 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.094604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2184  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  37.11 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08165  DNA repair protein RadC  39.58 
 
 		 305 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  41.41 
 
 		 263 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3773  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1904  DNA repair protein RadC  37.76 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000968261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36040  DNA repair protein RadC-like protein  38.78 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  39.18 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0308  RadC family DNA repair protein  36.73 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00747747  hitchhiker  0.00434898 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  37.76 
 
 		 242 aa  81.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  37.76 
 
 		 242 aa  81.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1032  DNA repair protein RadC  36.73 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  42.35 
 
 		 224 aa  80.5  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2636  DNA repair protein RadC  38.78 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  37.37 
 
 		 225 aa  80.5  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>