More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0625 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0625  DNA repair protein RadC, putative  100 
 
 		 218 aa  443  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.42242  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  35.71 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  36.11 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  34.26 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0257  DNA repair protein RadC, truncation  60.61 
 
 		 99 aa  137  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.784842  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0507  DNA repair protein RadC, truncation  60 
 
 		 135 aa  135  7.000000000000001e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  34.39 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  32.84 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  31.94 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4033  DNA repair protein RadC  35.91 
 
 		 225 aa  128  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  30.56 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  31.25 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  34.29 
 
 		 257 aa  121  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  28.31 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  28.57 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  27.78 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  30.33 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  30.33 
 
 		 236 aa  118  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0270  DNA repair protein RadC  34.93 
 
 		 211 aa  117  9e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  30.43 
 
 		 230 aa  117  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  31.43 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  30.48 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  34.07 
 
 		 244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  30.05 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  29.86 
 
 		 241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  29.38 
 
 		 265 aa  114  8.999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2548  DNA repair protein RadC  34.12 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0979  DNA repair protein RadC  32.38 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  30.95 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2646  DNA repair protein RadC  32.38 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2230  DNA repair protein RadC  32.38 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2099  DNA repair protein RadC  32.38 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.208076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1139  DNA repair protein RadC  32.38 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1020  DNA repair protein RadC  32.38 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.569834  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  29.81 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0781  DNA repair protein RadC  32.38 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  29.86 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  31.73 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2419  DNA repair protein RadC  34.12 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  hitchhiker  0.00254058 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0984  DNA repair protein RadC  32.38 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  30.96 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  31.43 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  27.94 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  29.33 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  29.52 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 257 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  29.38 
 
 		 242 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  29.86 
 
 		 260 aa  111  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0794  DNA repair protein RadC  31.43 
 
 		 256 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.132133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 257 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 257 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  26.36 
 
 		 254 aa  111  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  29.49 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  28.44 
 
 		 251 aa  111  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  29.38 
 
 		 275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  28.08 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  28.24 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  31.87 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  28.7 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  27.62 
 
 		 263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  33.54 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  27.31 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  27.14 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  32.91 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  29.05 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  29.38 
 
 		 275 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  31.34 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  28.44 
 
 		 278 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  29.81 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  31.03 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  30.43 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  26.96 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  29.52 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  27.49 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  27.19 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2695  DNA repair protein RadC  32.22 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1904  DNA repair protein RadC  31.18 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000968261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  27.49 
 
 		 246 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  28.57 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1733  DNA repair protein RadC  33.68 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.112707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  28.57 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000803057  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  28.71 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  28.57 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  27.62 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  29.81 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  28.11 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  28.1 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  29.81 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  29.33 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  27.62 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  27.86 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  29.05 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  29.82 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  29.82 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  30.64 
 
 		 234 aa  104  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  28.1 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  30.29 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  28.57 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>