57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0507 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0507  DNA repair protein RadC, truncation  100 
 
 		 135 aa  267  2.9999999999999997e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0625  DNA repair protein RadC, putative  60 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.42242  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  34.19 
 
 		 224 aa  86.7  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  30.65 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  29.93 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  27.03 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  24.22 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  26.72 
 
 		 278 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  26.09 
 
 		 245 aa  52.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  28.57 
 
 		 265 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  28.81 
 
 		 238 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  28.92 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  25.38 
 
 		 226 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  24.78 
 
 		 254 aa  50.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  24.22 
 
 		 275 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  23.89 
 
 		 257 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  25.44 
 
 		 254 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  28.16 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  24.22 
 
 		 275 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  24.41 
 
 		 248 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  24.41 
 
 		 248 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  23.2 
 
 		 241 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  24.56 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  27.12 
 
 		 224 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  26.5 
 
 		 251 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0781  DNA repair protein RadC  28.04 
 
 		 262 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1904  DNA repair protein RadC  32.84 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000968261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4033  DNA repair protein RadC  35.56 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0979  DNA repair protein RadC  28.04 
 
 		 278 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  25.62 
 
 		 203 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2099  DNA repair protein RadC  28.04 
 
 		 278 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.208076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0984  DNA repair protein RadC  28.04 
 
 		 278 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1020  DNA repair protein RadC  28.04 
 
 		 278 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.569834  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2230  DNA repair protein RadC  28.04 
 
 		 278 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2646  DNA repair protein RadC  28.04 
 
 		 278 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  23.21 
 
 		 263 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1139  DNA repair protein RadC  28.04 
 
 		 278 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  30.7 
 
 		 257 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  30.7 
 
 		 257 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  30.7 
 
 		 257 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  25.98 
 
 		 272 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  25.42 
 
 		 224 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  23.53 
 
 		 243 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  25.2 
 
 		 275 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  25.23 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  31.07 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  24.41 
 
 		 271 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  23.93 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  25.19 
 
 		 242 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  24.58 
 
 		 224 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0210  DNA repair protein RadC  26.67 
 
 		 244 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567078  normal  0.0524973 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  28.95 
 
 		 257 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0695  DNA repair protein RadC  30.34 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.63774 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  25.23 
 
 		 236 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  27.52 
 
 		 224 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0491  DNA repair protein RadC  29.82 
 
 		 226 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>