More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0229 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 236 aa  482  1e-135  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  42.66 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  42.92 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  41.74 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  39.55 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  38.46 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  38.16 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  39.25 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  38.79 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  35.37 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  37.38 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  37.38 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  40.19 
 
 		 250 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  36.99 
 
 		 254 aa  164  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  40.19 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  36.45 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  36.92 
 
 		 248 aa  161  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  35.87 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  33.63 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  33.79 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  35.48 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  36.92 
 
 		 275 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  38.25 
 
 		 261 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  37.38 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  38.32 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  36.92 
 
 		 275 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  35.59 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  36.45 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  35 
 
 		 257 aa  154  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  36.45 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  36.45 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  37.63 
 
 		 223 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  40.35 
 
 		 209 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_002978  WD0625  DNA repair protein RadC, putative  33.33 
 
 		 218 aa  141  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.42242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  36.07 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  38.15 
 
 		 203 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  36.84 
 
 		 196 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0781  DNA repair protein RadC  35.38 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0984  DNA repair protein RadC  34.43 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2230  DNA repair protein RadC  34.43 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2646  DNA repair protein RadC  34.43 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1139  DNA repair protein RadC  34.43 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1020  DNA repair protein RadC  34.43 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.569834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2099  DNA repair protein RadC  34.43 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.208076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0979  DNA repair protein RadC  34.43 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  32.74 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  31.58 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  30.7 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  35.45 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  30.37 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  32.24 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  32.08 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  31.43 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  35 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  31.19 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  27.47 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  30 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  31.6 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  27.88 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  29.25 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  29.25 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  29.25 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  29.25 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  31.6 
 
 		 224 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0794  DNA repair protein RadC  32.08 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.132133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  29.25 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  30.77 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  29.6 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2548  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2419  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  hitchhiker  0.00254058 
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  28.38 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  31.19 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  32.29 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  27.83 
 
 		 221 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1733  DNA repair protein RadC  36.1 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.112707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  28.05 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  32.24 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  32.24 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  32.24 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  27.36 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  28.3 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  32.41 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>