More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5205 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  45.95 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  50.7 
 
 		 247 aa  191  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  47.44 
 
 		 254 aa  191  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  48.84 
 
 		 275 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  48.37 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  45.97 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  46.98 
 
 		 278 aa  188  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  45.5 
 
 		 242 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  45.5 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  47.06 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 		 242 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  48 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  46.34 
 
 		 239 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  50.23 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  50.23 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  51.43 
 
 		 253 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  46.83 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  43.81 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  47.06 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  46.92 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  46.51 
 
 		 254 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  45.5 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  45.37 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  45.5 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  45.79 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  48.37 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  44.19 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  43.72 
 
 		 254 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  44.88 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  48.37 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  41.4 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  41.59 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  42.93 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  40.65 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  41.46 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  48.07 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  45.15 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  49.4 
 
 		 196 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  36.57 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  39.8 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 245 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  46.78 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3721  DNA repair protein RadC  48.85 
 
 		 138 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0768638  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  37.75 
 
 		 226 aa  134  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  35.59 
 
 		 228 aa  134  9e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  46.43 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  35.35 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1542  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  36.06 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  42.72 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  39.71 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  35.35 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  39.07 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  36.23 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  38.01 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  39.61 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  34.88 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  36.71 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  40.2 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  37.86 
 
 		 224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  37.86 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  40.19 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  34.13 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  37.79 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  34.13 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  34.13 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  34.13 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  34.13 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  34.13 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  36.54 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  34.13 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  39.9 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  34.13 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  37.91 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  34.13 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  35.75 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3359  DNA repair protein RadC  42.04 
 
 		 158 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  32.04 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  35.29 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  36.57 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  38.05 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  36.41 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  33.02 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  39.32 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  34.98 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  38.24 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  37.62 
 
 		 225 aa  124  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  40.29 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  36.65 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2319  DNA repair protein RadC  46.38 
 
 		 169 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.094604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>