More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1642 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  53.71 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  54.19 
 
 		 227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  51.3 
 
 		 230 aa  232  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  52.86 
 
 		 226 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  53.51 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  51.1 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  50.67 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  50.22 
 
 		 225 aa  214  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  50.22 
 
 		 225 aa  214  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  50.22 
 
 		 225 aa  214  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  50.22 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  49.78 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  49.78 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  49.78 
 
 		 225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  49.78 
 
 		 225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  47.19 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  47.39 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  49.34 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  50.22 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  49.57 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  48.26 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  46.98 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  48.73 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  47.47 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  48.25 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  47.83 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  46.93 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  45.25 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  54.44 
 
 		 206 aa  192  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  46.93 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  44.93 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  48.68 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  47.58 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  45.02 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  49.12 
 
 		 231 aa  188  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  41.92 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  48.68 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  45.41 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  44.98 
 
 		 227 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  45.41 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  43.84 
 
 		 213 aa  184  8e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  47.19 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  42.19 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  45.3 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  43.17 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  42.98 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  43.12 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  43.42 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  45.11 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  40.74 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  42.47 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  43.17 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  44.68 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  40.35 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  44.2 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  39.24 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  42.47 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  40.35 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  38.56 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  40.61 
 
 		 223 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  40.43 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  38.6 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  42.54 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  41.74 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  38.66 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  40.87 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  41.05 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  40.25 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  38.77 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 224 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  39.47 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  40.61 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  39.04 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  47.54 
 
 		 186 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  39.57 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  38.43 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05605  putative DNA repair protein  40.18 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.762004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  47.24 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  38.46 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  38.86 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0523  DNA repair protein RadC  37.39 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  37.55 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  39.3 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  36.4 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  36.24 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  39.32 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5335  DNA repair protein RadC  40.61 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  40.53 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  46.96 
 
 		 185 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  41.4 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  38.7 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  38.43 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  39.27 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>