More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0777 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  67.11 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  63.8 
 
 		 231 aa  287  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  65.78 
 
 		 233 aa  281  7.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  55.95 
 
 		 234 aa  254  7e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  50.23 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  50.23 
 
 		 225 aa  211  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  48.64 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  48.21 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  49.3 
 
 		 225 aa  208  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  54.05 
 
 		 227 aa  208  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  48.83 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  45.29 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  45.7 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  45.29 
 
 		 230 aa  201  9e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  52.75 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  43.86 
 
 		 229 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  44.59 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  53.85 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  45.02 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  46.05 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  44.14 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  43.06 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  41.63 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  43.6 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  43.6 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000803057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  43.6 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  41.89 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  42.18 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  42.2 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  41.7 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  42.2 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  41.94 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 227 aa  175  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  43.05 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  42.13 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  43.64 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  42.18 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  42.18 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  36.65 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  42.65 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  39.3 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  38.71 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  41.1 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  37.44 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  42.53 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  39.17 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  41.48 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  39.34 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  39.34 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  39.34 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  39.34 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  39.34 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  39.35 
 
 		 241 aa  164  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  38.57 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  38.53 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  40.37 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  38.71 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  36.97 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  41.48 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  39.34 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  38.36 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  37.28 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  38.71 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  37.9 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0186  DNA repair protein RadC  37.84 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.953222  hitchhiker  0.000000662884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  37.84 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  37.84 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0327  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000320995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  39.27 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  38.18 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  47.65 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  38.57 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  38.81 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3828  DNA repair protein RadC  36.82 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.760529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>