More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0172 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  72.43 
 
 		 243 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  74.27 
 
 		 243 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  72.61 
 
 		 243 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  72.61 
 
 		 243 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  69.71 
 
 		 243 aa  357  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1227  DNA repair protein RadC  66.94 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.179342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  40.44 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  40.89 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  39.65 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  39.39 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  38.77 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  41.4 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  37.78 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  37.78 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  37.78 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  38.22 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  37.33 
 
 		 225 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  39.11 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  37.72 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  36.56 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  37.12 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  40.34 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  37.66 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  39.11 
 
 		 227 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  38.56 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  37.45 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  38.57 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  39.3 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  39.09 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  36.6 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  38.7 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  37.23 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  39.47 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  38.18 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  40.44 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  38.67 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  39.55 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  39.65 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  36.24 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  37.87 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  41.78 
 
 		 229 aa  142  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  38.53 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  38.57 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  39.11 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  38.28 
 
 		 213 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0147  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 226 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  38.77 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  37.23 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  38.01 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  38.01 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  34.76 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  39.35 
 
 		 257 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  37.28 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  37.55 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  37.78 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  38.89 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  38.89 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  38.89 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  35.04 
 
 		 223 aa  135  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  32.63 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  36.56 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  38.16 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  42.95 
 
 		 206 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  35.93 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  35.86 
 
 		 238 aa  131  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 222 aa  131  9e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0794  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.132133 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  38.67 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  31.86 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  38.67 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  36.48 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  36.73 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1654  DNA repair protein RadC  36.25 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794365  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0523  DNA repair protein RadC  37.05 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  36.56 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0081  DNA repair protein RadC  36.28 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  38.7 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  35.62 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  37.72 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  36.17 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  36.94 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  33.48 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1095  DNA repair protein RadC  36.87 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.912816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1122  DNA repair protein RadC  39.53 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  36.44 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  37.73 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>