More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1122 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1122  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 223 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3935  DNA repair protein RadC  71.11 
 
 		 222 aa  306  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102944 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3937  DNA repair protein RadC  72.22 
 
 		 222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.040495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3965  DNA repair protein RadC  67.3 
 
 		 235 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.207152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3887  DNA repair protein RadC  66.35 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3824  DNA repair protein RadC  66.82 
 
 		 235 aa  261  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3262  DNA repair protein RadC  61.43 
 
 		 203 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3938  DNA repair protein RadC  64.33 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0199142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  41.98 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  43.93 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  40.67 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  41.04 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  41.04 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  38.86 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  39.53 
 
 		 243 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  40.19 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  39.62 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  39.15 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  33.17 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 215 aa  134  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  35.89 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  37.07 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  37.07 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  35.85 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  37.26 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  33.49 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  35.21 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  34.13 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  40.19 
 
 		 227 aa  127  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05605  putative DNA repair protein  34.76 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.762004  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  31.22 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  38.6 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  36.97 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  34.74 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  32.69 
 
 		 222 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  36.15 
 
 		 233 aa  125  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  39.71 
 
 		 257 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  39.71 
 
 		 257 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  39.71 
 
 		 257 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  34.6 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  38.89 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1095  DNA repair protein RadC  34.78 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.912816  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  39.23 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  34.6 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  37.32 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  38.76 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  31.03 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  37.8 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  36.2 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0781  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  30.81 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  37.86 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2099  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.208076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2230  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2646  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1139  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1020  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.569834  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  37 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0984  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0979  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  38.76 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  37.8 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  37.8 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 238 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  39.23 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  33.65 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  36.92 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  33.8 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  37.33 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3828  DNA repair protein RadC  35.71 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.760529  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  36.19 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  33.97 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4561  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000169917  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  33.8 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  35.71 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_002950  PG0894  DNA repair protein RadC  33.78 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.823184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  36.57 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  34.43 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  38.86 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  38.1 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  30.85 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  31.73 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>