More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0894 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0894  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.823184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0523  DNA repair protein RadC  47.35 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  43.61 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  43.61 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05605  putative DNA repair protein  45.87 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.762004  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  43.61 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  44.5 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5144  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  41.41 
 
 		 243 aa  178  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  41.28 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  38.33 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  37 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  38.33 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  38.53 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  36.12 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  38.33 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  36.56 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  37.39 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 223 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  36.84 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2119  DNA repair protein RadC  36.73 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  37.83 
 
 		 235 aa  144  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1834  DNA repair protein RadC  36.28 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  37 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  40.71 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  36.52 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  37 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  35.09 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  35.84 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  34.8 
 
 		 224 aa  141  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  33.92 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  36.12 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  35.62 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  35.84 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  36.15 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  37.89 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  37.28 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  35.4 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  35.68 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  33.92 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  34.11 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  35.39 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2162  DNA repair protein RadC  38.79 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  36.56 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  37.17 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  34.95 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3048  DNA repair protein RadC  34.98 
 
 		 221 aa  134  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000891178  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 224 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  36.84 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  36.96 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  36.84 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0491  DNA repair protein RadC  35.43 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  36.84 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  36.4 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3773  DNA repair protein RadC  34.71 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  37 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  34.36 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  34.8 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  34.96 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  34.36 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  36.4 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  37 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  35.11 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  34.36 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  34.8 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  36.56 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  33.92 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  35.84 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  35.53 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  32.89 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  32.74 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  35.24 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  34.75 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  36.24 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  34.67 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  36.12 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  32.74 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  34.26 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  38.26 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  38.26 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2553  DNA repair protein RadC  34.12 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  34.36 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  35.19 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5194  DNA repair protein RadC  33.04 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0102732  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  35.91 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5284  DNA repair protein RadC  33.04 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  32 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  32.3 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  33.79 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  34.8 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2409  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  33.92 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  36.57 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  33.92 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  34.36 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  34.65 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>