More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_14250 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 228 aa  455  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  53.98 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  52.86 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  54.05 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  52.89 
 
 		 232 aa  241  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  49.11 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  49.56 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  50.45 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  50.9 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  50.9 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  50.45 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  50.45 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  50.45 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  49.55 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  48.21 
 
 		 226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  49.1 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 227 aa  232  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  52.63 
 
 		 227 aa  231  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  49.56 
 
 		 227 aa  231  9e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  49.12 
 
 		 227 aa  228  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  52.47 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  50.45 
 
 		 229 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  49.56 
 
 		 229 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  51.38 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  48.25 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  48.68 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  47.56 
 
 		 229 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  47.79 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  43.5 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  47.53 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  46.64 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  44.91 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  44.39 
 
 		 228 aa  201  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  44.4 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  43.95 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  50.25 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  43.69 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  43.44 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  45.28 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  45.85 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  40.44 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  42.42 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  44.69 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  45.7 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  41.96 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  41.44 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  44.44 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  44.69 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1733  DNA repair protein RadC  42.58 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.112707  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  48.88 
 
 		 186 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  43.13 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  41.89 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  41.26 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  42.67 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  44.44 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  47.16 
 
 		 185 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  41.4 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  42.52 
 
 		 213 aa  175  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  39.29 
 
 		 237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  36.8 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  40.55 
 
 		 224 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  40.93 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  40.19 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  37.23 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  37.23 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  40.57 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  42.22 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  39.65 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  37.23 
 
 		 243 aa  168  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  40.64 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  41.12 
 
 		 222 aa  167  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 224 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  38.6 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  42.11 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0147  DNA repair protein RadC  42.65 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  41.71 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  39.52 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  38.67 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  39.01 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  38.57 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  41.04 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  37.39 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>