More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0735 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  76.13 
 
 		 223 aa  362  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  74.32 
 
 		 222 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  70.27 
 
 		 223 aa  338  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  68.02 
 
 		 222 aa  332  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  67.26 
 
 		 223 aa  327  8e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  63.06 
 
 		 222 aa  312  1.9999999999999998e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  47.53 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  46.4 
 
 		 227 aa  197  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  41.94 
 
 		 228 aa  191  9e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  46.4 
 
 		 241 aa  189  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  44.59 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  44 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  45.83 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  45.33 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  44.04 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  42.34 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  44.04 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  42.79 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  44.04 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  41.44 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  42.54 
 
 		 230 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  42.6 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  44.59 
 
 		 236 aa  174  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  44.84 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  43.3 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  42.04 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  43.18 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  43.95 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  48.44 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  41.78 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  41.59 
 
 		 215 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  41.85 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  41.12 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  40.18 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 234 aa  161  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  40.18 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  40.27 
 
 		 229 aa  157  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  38.91 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05605  putative DNA repair protein  39.63 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.762004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 235 aa  155  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  39.44 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  39.44 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3048  DNA repair protein RadC  39.55 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000891178  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  41.78 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  38.91 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  43.05 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  39.01 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  38.01 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0081  DNA repair protein RadC  36.65 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  38.03 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  38.03 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1718  DNA repair protein RadC  45.56 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1752  DNA repair protein RadC  45.56 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.351254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  38.03 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  38.03 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  39.63 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  45.76 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  38.03 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  38.03 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  38.03 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  38.03 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0523  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  37.05 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  37.05 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  39.53 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  39.09 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  42.61 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  36.16 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5144  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  37.74 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00049  DNA repair protein RadC  36.52 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00103184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  36.44 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  35.87 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  36.16 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>