More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0881 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 228 aa  455  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  48.87 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  47.75 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  47.51 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  44.39 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  45.25 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  44.8 
 
 		 225 aa  195  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  44.34 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  43.89 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  43.89 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  43.89 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  43.44 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  43.44 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  44.84 
 
 		 222 aa  191  9e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  43.44 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  45.09 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  43.81 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  43.95 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  45.54 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  44.59 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  44.64 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  43.06 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  44.44 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  42.98 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  41.89 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  39.56 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  40.76 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  39.11 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  43.42 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  40.69 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  41.96 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  44 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  39.3 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  37.78 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1095  DNA repair protein RadC  42.45 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.912816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  38.77 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  38.84 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  38.53 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  38.86 
 
 		 223 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  40.18 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  38.84 
 
 		 231 aa  161  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  40.18 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  37.22 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  38.46 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  38.74 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  38.01 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  38.71 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  37.9 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  35 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  35.68 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  37.99 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  38.97 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  37.99 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  37.33 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  36.12 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  35.09 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  35 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  35.87 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  35.43 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  39.62 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  38.67 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  39.21 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  35 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  34.82 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  36.53 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  39.34 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  37.22 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  35.43 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  34.98 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  37.72 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  39.56 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  34.98 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  35.16 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  33.63 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  37.05 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  36.96 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  37.74 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5335  DNA repair protein RadC  35.27 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>