More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0176 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  55.5 
 
 		 213 aa  239  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  50.71 
 
 		 215 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  50.71 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  47.32 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  45.45 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  44.04 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  44.09 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  40.74 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  43.58 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  44.13 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  43.4 
 
 		 227 aa  171  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  41.86 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  39.44 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  41.86 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  41.86 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  41.86 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  41.86 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  41.86 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  41.86 
 
 		 225 aa  167  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  41.86 
 
 		 225 aa  167  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  41.98 
 
 		 241 aa  167  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  41.4 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  43.12 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  39.81 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  38.79 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  42.45 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  43.27 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  39.35 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  43.89 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  39.51 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  42.08 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  39.11 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  36.15 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  38.18 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  36.24 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  38.79 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  38.67 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  36.4 
 
 		 231 aa  154  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  38.43 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  36.57 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  36.99 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  38.53 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  38.65 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  37.68 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  40 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  37.68 
 
 		 224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  36.53 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  39.63 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  36.07 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  40.78 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  37.74 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  39.55 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  38.65 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  38.67 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  37.26 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  38.68 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  36.27 
 
 		 228 aa  147  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  38.32 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  35.91 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  36.84 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  38.6 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  35.41 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  37.74 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  38.74 
 
 		 221 aa  144  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  36.71 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  38.71 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  38.39 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  35.19 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  38.46 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  38.94 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  34.93 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  36.53 
 
 		 257 aa  141  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>