More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1101 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  67.12 
 
 		 228 aa  313  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1095  DNA repair protein RadC  50.24 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.912816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  43.66 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  44.13 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  43.66 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  42.65 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  43.66 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  43.66 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  43.66 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  43.66 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  43.66 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  43.19 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  41.23 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  38.86 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  42.06 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  42.38 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  36.61 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  39.63 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  41.59 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  41.59 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  38.97 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  36.15 
 
 		 221 aa  158  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  37.21 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  38.46 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  38.97 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  41.23 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  41.2 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  35.65 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  35.81 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  35.21 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  35.35 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  35.35 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  37.04 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  35.35 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  36.07 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  45.56 
 
 		 186 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  37.09 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  35.05 
 
 		 214 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  35.21 
 
 		 224 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  37.85 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  36.57 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  33.8 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  34.88 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 221 aa  148  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  37.74 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  39.34 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  37.32 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  34.93 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  38.68 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  34.27 
 
 		 229 aa  148  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  37.09 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  34.91 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  38.14 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  33.95 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  37.8 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  33.95 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  33.95 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  33.95 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  33.95 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  34.11 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  35.68 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  36.65 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  34.68 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  36.45 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  35.55 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  35.07 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  32.23 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  41.92 
 
 		 185 aa  141  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  34.72 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  33.49 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  37.21 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  36.82 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  36.82 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  34.93 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  33.18 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  32.54 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0894  DNA repair protein RadC  34.11 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.823184 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000803057  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>