More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1430 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 228 aa  463  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  67.12 
 
 		 226 aa  313  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1095  DNA repair protein RadC  48.33 
 
 		 217 aa  211  9e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.912816  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  45.71 
 
 		 226 aa  184  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  45.24 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  40.48 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  41.1 
 
 		 225 aa  167  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  41.1 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  41.1 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  41.1 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  41.1 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  40.64 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  40.64 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  41.1 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  41.12 
 
 		 227 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  40.48 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  40.65 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  40.95 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  42.18 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  38.97 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  40.19 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  37.98 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  37.04 
 
 		 221 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  40.57 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  37.62 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  39.25 
 
 		 213 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  39.05 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  40.47 
 
 		 222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 215 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  38.57 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  38.28 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  38.28 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  38.86 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  38.68 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  36.84 
 
 		 228 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  36.79 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  37.74 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  37.91 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  38.28 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  38.28 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  34.25 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  36.45 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  35.89 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  35.55 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  35.55 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  35.55 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  37.91 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  35.55 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  35.55 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  35.55 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  35.55 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 221 aa  144  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  37.62 
 
 		 224 aa  144  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 221 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 221 aa  144  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  34.29 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0523  DNA repair protein RadC  36.97 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  35.91 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  35.24 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  38.6 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  35.85 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  35.89 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  35.07 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  35.21 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  39.05 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  35.24 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0894  DNA repair protein RadC  36.15 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.823184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  42.94 
 
 		 186 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  34.45 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3828  DNA repair protein RadC  37.62 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.760529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  35.85 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  35.24 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  34.76 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  36.02 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  35.27 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1225  truncated DNA repair protein RadC  42.01 
 
 		 184 aa  134  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.247593  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0326  DNA repair protein RadC  35.24 
 
 		 225 aa  134  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  34.7 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05605  putative DNA repair protein  36.19 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.762004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>