More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1095 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1095  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.912816  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  50.24 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  48.33 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  45.54 
 
 		 226 aa  174  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  43.66 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  42.45 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 227 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  40.57 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  40.57 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  40.57 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  39.62 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  39.62 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  38.1 
 
 		 221 aa  154  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  37.26 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  37.62 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  41.23 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  36.19 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  37.98 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  37.26 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  38.1 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  35.85 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  38.68 
 
 		 229 aa  148  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  35.85 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  35.85 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  35.85 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  35.85 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  35.85 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  35.85 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  37.38 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  36.19 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  38.21 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  39.25 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  36.02 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  36.19 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  36.19 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  35.55 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  38.1 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  36.92 
 
 		 227 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  35.38 
 
 		 222 aa  144  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  37.26 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  37.62 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  36.19 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  36.7 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  36.02 
 
 		 236 aa  141  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  35.21 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  35.35 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  37.91 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  34.12 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  35.85 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  38.03 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3828  DNA repair protein RadC  35.07 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.760529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  34.58 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  35.71 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  35.35 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0327  DNA repair protein RadC  36.02 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000320995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  34.12 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  37.79 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  34.12 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  34.27 
 
 		 228 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  36.15 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  36.79 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  35.38 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  32.69 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4561  DNA repair protein RadC  35.07 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000169917  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  34.62 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  36.02 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  35.07 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  36.19 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  35.55 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  36.19 
 
 		 224 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  36.02 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 229 aa  134  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  34.6 
 
 		 224 aa  134  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  32.38 
 
 		 224 aa  134  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  34.43 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3048  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000891178  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>