More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0536 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  100 
 
 
229 aa  450  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  60 
 
 
233 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  61.61 
 
 
230 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  57.92 
 
 
236 aa  267  8e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  58.74 
 
 
227 aa  264  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  55.86 
 
 
226 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  64.86 
 
 
227 aa  254  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  56.62 
 
 
225 aa  251  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  55.86 
 
 
226 aa  251  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  56.16 
 
 
225 aa  250  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  55.71 
 
 
225 aa  250  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  56.16 
 
 
225 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  56.16 
 
 
225 aa  249  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  56.16 
 
 
225 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  55.71 
 
 
225 aa  248  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  55.71 
 
 
225 aa  248  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  54.79 
 
 
225 aa  247  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  53.51 
 
 
235 aa  245  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  57.27 
 
 
227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  48.66 
 
 
229 aa  232  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  58.48 
 
 
232 aa  230  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  48.67 
 
 
227 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  52.86 
 
 
234 aa  226  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  48.23 
 
 
227 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  52.47 
 
 
228 aa  222  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  52.02 
 
 
231 aa  221  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  47.32 
 
 
229 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  49.13 
 
 
229 aa  215  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  53.85 
 
 
229 aa  211  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  48.93 
 
 
241 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  48.02 
 
 
227 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  50.86 
 
 
228 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  53.51 
 
 
230 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  50.73 
 
 
206 aa  202  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  52.91 
 
 
233 aa  201  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  54.71 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  49.3 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  48.5 
 
 
229 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  48.44 
 
 
229 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  47.53 
 
 
228 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  46.64 
 
 
228 aa  191  9e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  46.85 
 
 
222 aa  189  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  44 
 
 
228 aa  189  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  52.81 
 
 
186 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  47.11 
 
 
227 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  48.44 
 
 
223 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  52.27 
 
 
185 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  55.97 
 
 
231 aa  184  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  46.28 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  45.45 
 
 
231 aa  181  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  43.89 
 
 
223 aa  180  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  46.61 
 
 
223 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  41.05 
 
 
232 aa  179  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  47.06 
 
 
222 aa  179  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  43.66 
 
 
213 aa  177  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  47.3 
 
 
223 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  43.75 
 
 
224 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  44.64 
 
 
224 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  43.89 
 
 
225 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  45.18 
 
 
245 aa  174  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  43.93 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  44.09 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  43.98 
 
 
222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  39.81 
 
 
222 aa  171  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  46.22 
 
 
222 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  43.32 
 
 
246 aa  169  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 
224 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  41.96 
 
 
224 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 
228 aa  169  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  43.75 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  41.07 
 
 
224 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  44.24 
 
 
222 aa  165  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  43.64 
 
 
224 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  41.33 
 
 
243 aa  164  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  42.79 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  42.41 
 
 
224 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 
224 aa  161  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 
223 aa  161  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  41.52 
 
 
224 aa  161  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 
224 aa  161  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 
243 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  41.52 
 
 
224 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  42.41 
 
 
224 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  42.34 
 
 
224 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  41.52 
 
 
224 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  36.94 
 
 
225 aa  158  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 
224 aa  158  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  46.46 
 
 
226 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  41.78 
 
 
243 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0147  DNA repair protein RadC  48.33 
 
 
226 aa  155  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  42.22 
 
 
242 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  41.07 
 
 
224 aa  156  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  42.67 
 
 
225 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  39.74 
 
 
243 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  44.8 
 
 
223 aa  155  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  39.74 
 
 
243 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  39.29 
 
 
224 aa  154  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 
232 aa  152  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 
228 aa  151  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 
221 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>